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- 2023-09-03 发布于上海
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桃花芽休眠解除SSH文库构建及相关基因的功能分析的中期报告
本中期报告主要包括桃花芽休眠解除SSH文库构建和相关基因的功能分析两个部分。
一、桃花芽休眠解除SSH文库构建
1. 样本采集和RNA提取
从桃树的休眠期和解除期分别采集芽组织样品,分别命名为Dormant和Reactive。采集后,立即置于液氮中冷冻保存。使用Trizol试剂将样品中的RNA提取出来。
2. SSH文库构建
使用Clontech公司的SMARTer PCR cDNA合成试剂盒将两个样品的RNA转录成cDNA。随后,使用Clontech公司的PCR-Select cDNA Subtractive Hybridization Kit构建 SSH文库。其中,Dormant作为参比组,Reactive样品为试验组。最终得到了休眠期芽组织解除SSH文库。
3. 文库筛选和验证
对SSH文库进行筛选,筛选出不同ially expressed基因。使用qPCR对筛选到的基因进行验证,验证其在休眠期和解除期的表达模式是否与SSH文库中所述相同。
二、相关基因的功能分析
1. 基因注释和序列分析
使用NCBI的BLAST程序将SSH文库中所得的休眠解除相关基因序列进行注释和分析。根据BLAST查询结果,对相关基因的序列进行比对、聚类和进化分析。
2. 生物学功能分析
参看已有研究,对相关基因的生物学功能进行预测。通过广泛的
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