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- 2023-09-07 发布于上海
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两个拟南芥microRNAs在转录水平上对基因表达的调控分析的中期报告
简介:
拟南芥是一种模式植物,在分子生物学和遗传学研究中被广泛应用。microRNAs是一类长度约为20-24个核苷酸的小RNA分子,可在转录后水平上调控基因表达。本研究旨在分析两个拟南芥microRNAs(miR156和miR172)在转录水平上对其靶基因表达的影响。
实验设计:
使用qRT-PCR技术对野生型拟南芥中miR156和miR172的表达量进行检测,并分别构建过表达miR156和miR172的转基因拟南芥株系。使用RNA-Seq技术分析过表达miR156和miR172植株中的差异表达基因,并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析。最后,使用qRT-PCR验证RNA-Seq结果。
结果:
qRT-PCR结果表明,在野生型拟南芥中,miR156和miR172的表达量均比较高,在转基因株系中,miR156和miR172的表达量分别比野生型拟南芥高23倍和15倍。RNA-Seq结果表明,过表达miR156和miR172植株中有大量基因得到了上调或下调。GO分析表明,这些差异表达基因主要涉及到生长和代谢过程,KEGG分析表明与花发育、激素信号和光合作用等相关的信号通路也受到了调控。qRT-PCR验证结果表明RNA-Seq结果的可靠性。
结论:
miR156和miR172在转录水平上调节拟南芥基因表达,具有
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