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我国特有植物青檀遗传结构的ISSR分析
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李晓红,张 慧,王德元,张 莉,邵剑文,2,*,张小平,3
(1. 安徽师范大学生命科学学院, 芜湖 241000;2. 生物环境与生态安全安徽省高校重点实验室, 芜湖 241000;3. 安徽省重要生物资源保护与利用研究重点实验室, 芜湖 241000)
我国特有植物青檀遗传结构的ISSR分析
李晓红1,张 慧1,王德元1,张 莉1,邵剑文1,2,*,张小平1,3
(1. 安徽师范大学生命科学学院, 芜湖 241000;2. 生物环境与生态安全安徽省高校重点实验室, 芜湖 241000;3. 安徽省重要生物资源保护与利用研究重点实验室, 芜湖 241000)
青檀是我国特有的第三纪残遗植物,是宣纸纤维来源的重要原材料,现已被列入国家Ⅲ级保护植物。采用简单序列重复区间扩增多态性(ISSR)标记技术,对采自27个地理种群的628个青檀个体的遗传多样性和遗传结构进行了检测。8对引物共得到66个清晰的扩增位点,其中多态性位点63个,多态性位点百分率为95.45%。分析结果表明,青檀在物种水平上具有很高的遗传多样性(PPB=95.45%、Ao=1.9545、Ae=1.5729、He=0.3335、I=0.4980、Hb=0.3437)。在种群水平上的遗传多样性(PPB=69.98%、Ao=1.6998、Ae=1.4449、He=0.2561、I=0.3793、Hb=0.2656)和种群间遗传分化水平(Gst=0.23,ФST=0.25)均处于中等水平。华北地区(30°—42°N)和华南地区(22°—30° N)青檀的遗传多样性和遗传结构的差异并不显著。古老的起源历史、较广的分布范围、异交的繁育系统、风媒种子、长命的生活史以及华南和华北地形和植被的差异可能是导致青檀目前遗传格局的主要原因。结合叶绿体序列(cpDNA)序列的遗传结构特征对青檀的保护策略进行了探讨。
青檀;ISSR;遗传多样性;遗传结构;保护策略
青檀(PteroceltistatarinowiiMaxim.)为我国特有第三纪残遗温带落叶树种,隶属于榆科(Ulmaceae)唯一的单种属——青檀属 (Pteroceltis)。该树种对气候的适应幅度较宽,抗逆性高,萌生能力强,是钙质土壤石灰岩植物群落中的先锋树种,在我国的分布范围十分广泛,在华北、华东、华中和华南均有分布,其分布中心在华东,其中以安徽宣城、宁国、泾县分布最为集中[1- 2]。作为我国特有的经济纤维树种,青檀是“文房四宝”之首——宣纸的重要原材料(韧皮纤维)来源,已被列入国家Ⅲ级珍稀保护植物名录[3- 4]。目前许多研究人员从不同角度对该物种进行了相关研究,包括青檀的群落种群特征[5- 8]、种子休眠机制[9]、檀皮质量的影响因素、化学成分、人工林的苗木培育技术[1,10]、内生真菌[11]等方面。
了解一个物种的遗传多样性及其结构不仅可以加深人们对该植物进化历史和适应机制的认识[12- 14],还可为该植物的保护、品种选育和栽培利用提供指导[15- 17]。在青檀种内遗传多样性的研究方面,李晓红等2012年对代表青檀分布区的28个种群(共284个个体)的叶绿体序列 (trnS-trnG 和psbA-trnH) 进行了分析,从母系遗传的角度揭示了中国南部(北纬30°以南)青檀遗传多样性较高,种群间分化显著,而中国北部(北纬30°以北)遗传多样性相对较低,种群间分化相对较小,并推测青檀在第四纪冰期可能具有多个避难所[18]。然而一个物种双亲遗传的核基因多样性才是该物种遗传多样性的主体部分,更能体现该物种适应和进化的潜力[19]。至今,有关青檀核基因的遗传多样性和遗传结构的研究尚不全面。Chai等利用ISSR分子标记对安徽、山东、江苏和河南四省5个青檀野生种群的样品进行了研究[20];李建华等对湖北大贵寺国家森林公园不同海拔高度的野生青檀的种群遗传多样性进行了分析[21],这些研究使我们对青檀的核基因遗传多样性有了初步的了解,然而由于两者的取样点相对于青檀的整体分布区相对较少,样点分布也偏于集中,因而均未能全面揭示广布种青檀物种水平上的遗传多样性和分布格局。
简单序列重复区间多态性(ISSR)是Zietkeiwitcz等于1994年发展起来的一种基于微卫星基础上的分子标记[22]。它虽然是一种显性遗传标记,不能区分纯合体与杂合体,然而由于ISSR比等位酶、限制性片段长度多态性(RFLP)、微卫星(SSR)等技术简单易行、多态性高,因而近年来应用ISSR技术分析植物遗传多样性的研究已有大量报道[23- 24]。本研究采用ISSR分子标记,在整个分布区取样的基础上,拟从核基因的角度研究:1)青檀的遗传多样性和遗传结构;2)中国南部和北部青檀的遗传多样性及其分
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