耐盐碱植物星星草的转录组研究的中期报告.docx

耐盐碱植物星星草的转录组研究的中期报告 尊敬的评审专家们，我是XXX，我负责的研究项目是耐盐碱植物星星草的转录组研究。今天我向大家汇报一下这个项目的中期进展。 首先，我想简单介绍一下我们研究的对象——星星草。 星星草是一种广泛分布于中国北方荒漠地区的青草，具有较强的耐盐碱特性。因此，它被广泛应用于盐碱土的植被修复和固沙防风领域。星星草的适应特点，对于研究植物对胁迫的响应机制和改良土地资源具有重要意义。 本次研究我们选取耐盐碱的星星草，采用高通量测序技术对其转录组进行测序，并对转录组数据进行深入分析。 目前，我们已经完成了星星草转录组的测序工作。在Illumina Hiseq平台上，我们得到了总计约400万条序列，总计约200 Gb的数据。利用Trinity软件对这些序列进行拼接和组装，获得165,881条拼接序列，其中N50为1,854 bp，平均长度为1,189 bp。 我们将这些序列进行了基因注释和生物信息学分析。通过对已知基因库的比对，我们得到了111,307个同源基因，占到总序列数的67%。此外，我们还预测了大量新的基因和转录本。在功能注释方面，我们利用GO和KEGG对基因功能进行了分析，并对转录因子、非编码RNA等与胁迫响应相关的基因进行了筛选和分析。 除此之外，我们还对样本进行了RNA提取和定量，以及qPCR的验证实验。通过qPCR实验证实，我们得到了一批不同表达水平的基因，包括响应盐碱胁迫的转录因子、抗氧化酶等。 未来的工作中，我们将继续对部分亮点基因进行进一步研究和验证，以更深入地揭示星星草在盐碱胁迫下的响应机制和调控网络。 谢谢各位专家的听取。