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利用基因芯片技术筛选奶牛外周血热应激相关基因的中期报告
引言
热应激是奶牛生产中面临的常见问题之一。热应激不仅会影响奶牛的生产性能、健康和福利,还会造成经济损失和环境影响。因此,对于奶牛的热应激反应机制和相应的基因进行研究具有重要意义。本研究旨在利用基因芯片技术筛选奶牛外周血热应激相关基因,为进一步研究奶牛的热应激反应机制提供基础数据支持。
材料与方法
实验动物:本研究选取10头3-4岁的健康荷斯坦奶牛。
实验设计:将10头奶牛随机分为两组:5头为热应激组,5头为对照组。对照组在常温下饲养;热应激组在高温环境下(32℃,湿度80%)饲养10天,每天热应激时间为4小时,其余时间在常温下饲养。
外周血采集:在热应激后第10天的上午,对10头奶牛进行外周血采集(采用EDTA抗凝管采集)。
RNA提取:将外周血提取RNA,用Nanodrop 2000c光谱仪检测RNA样品的纯度和浓度。
基因芯片检测:将RNA样品使用Agilent 2100电泳仪检测RNA完整性,选择RNA完好的样品进行基因芯片检测(Agilent Bovine Gene Expression Microarray)。经过预处理和标准化后,利用学生t检验进行差异分析,筛选差异表达显著的基因。
结果分析
经过基因芯片检测和差异分析,共筛选出246个差异表达显著的基因(p0.05)。其中,有132个基因在热应激组中表达量显著上调,114个基因在热应激组中表达量显著下调。通过GO和KEGG富集分析,发现上调基因主要参与了免疫反应、调节细胞周期和蛋白质代谢等生物过程,下调基因主要参与了细胞信号转导、细胞凋亡和免疫调节等生物过程。
结论
本研究利用基因芯片技术筛选出246个差异表达显著的基因,初步揭示了奶牛在热应激下可能参与的基因调控网络。这些基因涉及的生物过程对于奶牛在热应激下的生存需求和适应能力具有重要意义,为进一步研究奶牛的热应激反应机制提供了基础数据支持。
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