一株花椒根腐病拮抗菌的分离鉴定及全基因组序列分析.docxVIP

一株花椒根腐病拮抗菌的分离鉴定及全基因组序列 分析 一、引言 花椒是中国传统重要的香辛料作物，其干果富含丰富的挥发油和生物活性成分，具有抗菌、降血压、保肝、抗氧化等生理功能。然而，花椒生产中存在一些病害问题，其中根腐病是最常见且严重的病害之一，严重危害了花椒生产的发展。目前，多数资料证明拮抗菌在植物病害生防和生物肥料中应用比较广泛，具有应用前景，因此本研究旨在从花椒根际土壤中分离鉴定根腐病拮抗菌，并开展其全基因组序列分析。 二、材料与方法 （一）土样采集和拮抗菌筛选 采集花椒根际土壤样品，经过分离纯化后，进行拮抗菌筛选。首先制备拮抗菌筛选培养基，并进行预处理，待处理后的培养基加入细菌物种菌培养液，孵育至对照菌液培养的百分之十五左右。接着，将拮抗菌筛选培养基转移到培养底物中，用无菌棉签再将拮抗菌接种在培养底物上，用塑料膜封好，用小针在中间扎一孔，培养 24 小时。最后，选择对根腐病菌的生长具有抑制作用的菌株，进行鉴定。 （二）鉴定拮抗菌株菌株特性 对最终得到的拮抗菌株进行研究，观察其形态特征，进行生化反应测试和 16S rDNA 分子生物学鉴定。 （三）拮抗菌全基因组测序和分析 采用 Illumina 高通量测序技术，对拮抗菌株进行全基因组测序，利用多种生物信息学方法和数据库进行分析，进行基因注释、基因功能预测、基因结构分析、代谢通路分析、基因家族分析、同源基因比对、基因进化分析、重