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基于质谱的小麦蛋白质鉴定平台的建立及赤霉病抗性相关转录组分析的中期报告
针对小麦生产中的赤霉病问题,我们建立了一个基于质谱的小麦蛋白质鉴定平台,可以分析小麦中的蛋白质组成和定量。同时,我们对赤霉病抗性相关的小麦品种进行了转录组分析。以下是我们的中期报告。
一、基于质谱的小麦蛋白质鉴定平台的建立
1. 样品准备
我们采用了不同生长阶段和品种的小麦籽粒作为样品。样品经过细胞壁分离和蛋白质提取处理后,使用二维凝胶电泳法分离和检测蛋白质组成。同时,我们还使用液相色谱串联质谱法(LC-MS/MS)进行蛋白质鉴定。
2. 数据分析
通过二维凝胶电泳结合LC-MS/MS技术,我们成功鉴定了多个小麦品种中的蛋白质,包括酶类、亲水性蛋白、非亲水性蛋白等。通过对比分析,我们发现不同品种和生长阶段的小麦中蛋白质的组成变化较大。
二、赤霉病抗性相关转录组分析
1. 样品准备
我们选取抗性较强和较弱的两个小麦品种进行研究,分别处理它们的小麦叶片样品。处理分为两组,一组是接种赤霉病霉菌后采样,另一组是未接种霉菌的正常采样。采样后,使用RNA提取和净化方法获取RNA样品。
2. 数据分析
我们使用Illumina HiSeq高通量测序技术对RNA样品进行测序,并进行差异表达基因筛选和功能注释分析。初步结果显示,在接种赤霉病霉菌后,抗性较强的小麦品种中的抗病相关基因表达量较高,而抗性较弱的品种中则表达量较低。
未来工作
我们将进一步分析蛋白质组成和转录组差异表达基因的机制,明确抗性相关蛋白或基因的功能,并开展更多的小麦品种研究,为小麦抗赤霉病育种提供理论和实践依据。
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