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荧光定量PCR操作流程
目的基因引物的合成
设计合成200-300bp目的基因片段的引物,利用primer 5.0引物设计工具或者手工合成,引物合成过程中注意上下游的Tm值要相似、GC碱基在上下游的引物里均匀、引物与模板序列紧密互补、引物间避免形成稳定的二聚体或发夹结构等事项。
2 总RNA提取
(1)准备 研钵(灭菌)、离心管(1.5ML),枪头、 手套(一次性)、异丙醇、乙醇,三氯甲烷
2)取适量家蚕组织,加液氮充分研磨;匀浆加1ml RNAiso Plus后匀浆;
3)室温放置5min (可在-70℃下保存1个月)
4)加0.2ml氯仿(chloroform),振荡混匀,室温放置5分钟;
5)12000g,15min,4℃;
6)取上清(约0.6ml),加与上清等体积异丙醇,室温放置10分钟;
7)12000g,10min,4℃;
8)取沉淀(RNA呈胶状沉淀),加1ml 75%乙醇(可在-20℃保存1年)洗涤;
9)12000g,5min,4℃;
10)取沉淀,室温干燥10min;
11)溶解于DEPC处理水中
12)-80℃保存,尽快使用,或在8)保存。
3 反转录(TOYOBO试剂盒)
Nuclease-free water up to 10ul
5ⅹRT buffer 2ul
RT Enzyme Mix 0.5ul
Primer Mix 0.5ul
RNA 0.5-1ug
10ul
37℃
37℃ 水浴15min
98℃ ,5min水浴使酶失活
反应结束,保存于4℃或者-20℃条件下备用(一般定量PCR时稀释20倍)
定量PCR反应(本实验室7300系统)
SYBR 10ul
Forward Primer 1ul
Reverse Primer 1ul
ROX Ⅰ 0.4ul
c DNA模板 2ul
d H2O 5.6ul
20ul
一个模板重复三次以尽量减小误差;每个模板都要设内参。内参是生物体或者细胞中稳定表达的基因,表达量几乎不变。而后按照试剂盒说明操作流程设定仪器参数即可。
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