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木薯耐寒相关microRNA的差异表达分析的中期报告
本次中期报告旨在介绍关于木薯耐寒相关microRNA的差异表达分析的进展情况。首先,我们进行了文献调研,搜集了大量有关木薯耐寒方面的相关研究,并结合已有的基因组数据,选取了合适的样品进行miRNA测序。在测序前,我们对样品进行了RNA提取和质量检测,确保样品的RNA完整性和纯度。miRNA测序采用Illumina HiSEQ X10平台,获得了大量高质量的读数。接下来,我们进行了差异表达分析,发现了一些与木薯耐寒相关的不同ially expressed miRNA。
我们进一步利用KEGG数据库和GO富集分析,对差异ially expressed miRNA进行了生物信息学分析,预测它们与木薯耐寒的调控网络有关。此外,我们还对一些有代表性的miRNA进行了qPCR验证,结果表明与测序结果相符。未来,我们将进一步对这些miRNA进行功能研究,探究它们在木薯耐寒中的作用机制。
在研究过程中,我们也遇到了一些问题,例如miRNA测序中的低比对率、miRNA预测的精度以及生物信息学分析中的误差等。我们会在后面的研究中继续优化实验方法,并采用一些新的分析方法来解决这些问题。
综上,我们目前的研究进展表明miRNA在木薯耐寒中起到了重要的调控作用,这将有助于深入了解木薯的耐寒机制,并有望为木薯的耐寒育种提供新的思路和途径。
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