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重测序BSA项目结题报告 客户单位: 报告单位: 联系人: 联系电话: 传真: 报告日期: 项目负责人: 审核人: 重测序 重测序 BSA 项目结题报告 重测序 重测序 BSA 项目结题报告 目录 目录 1 项目概况 1 合同关键指标 1 项目基本信息 1 项目执行情况 2 项目结果概述 2 项目流程 3 实验流程 3 信息分析流程 3 生物信息学分析 5 测序数据质控 5 原始数据介绍 5 碱基测序质量分布 7 碱基类型分布 9 低质量数据过滤 10 测序数据统计 10 与参考基因组比对统计 11 比对结果统计 11 插入片段分布统计 11 深度分布统计 12 SNP 检测与注释 14 样品与参考基因组间 SNP 的检测 14 样品之间 SNP 的检测 17 SNP 结果注释 19 Small InDel 检测与注释 22 样品与参考基因组间 Small InDel 的检测 22 样品之间 Small InDel 检测 22 1 Small InDel 的注释 23 关联分析 26 高质量 SNP 筛选 26 SNP-index 方法关联结果 26 ED 方法关联结果 28 候选区域筛选 29 候选区域的功能注释 30 候选区域的 SNP 注释 30 候选区域的基因注