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基于微扰理论的分子动力学模拟新方法--扩展Langevin动力学的中期报告 简介： 扩展Langevin动力学（ELD）是一种基于微扰理论的分子动力学模拟新方法。与传统的Langevin动力学相比，ELD将系统分解为多个子系统，每个子系统都被赋予不同的温度和阻尼系数。这种方法可以更好地模拟多温度体系中的动力学行为，特别是在温度梯度和温差方面。本文介绍了ELD的基本原理和算法，并用一个简单的模型系统进行了测试。结果表明，ELD对多温度体系中的动力学行为具有良好的模拟效果。 方法： ELD将整个系统分解为多个子系统，并引入不同的阻尼系数和温度。每个子系统都受到一个Langevin力，该力与温度和阻尼系数的大小有关。系统的总势能是所有子系统的势能之和。ELD使用基于Verlet算法的积分方法来模拟系统的演化。具体算法如下： 1. 初始化多个子系统的位置和速度。 2. 根据不同子系统的温度和阻尼系数计算每个子系统受到的Langevin力。 3. 计算每个子系统的势能和力。 4. 使用Verlet算法计算每个子系统的运动。 5. 重复2-4步直到达到所需的模拟时间。 结果： 为了测试ELD方法的有效性，我们使用了一个简单的粒子系统模型：包含500个粒子的球体，每个粒子受到Lennard-Jones势的作用力。我们将系统分为左右两个子系统，并给每个子系统不同的温度和阻尼系数。左侧子系统温度为2