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罗非鱼不同群体mtDNA D-loop区遗传多样性分析的中期报告 罗非鱼（Oreochromis Niloticus）是一种常见的耐盐淡水鱼类，广泛分布于热带和亚热带地区。该鱼种在食品、种苗和水产养殖等方面有广泛应用。细胞质DNA（mtDNA）在种群遗传学中具有重要的作用，因为它是细胞质中唯一具有自我复制能力的DNA，并且通过遗传途径只能从母亲传递给后代。因此，对罗非鱼不同群体mtDNA D-loop区遗传多样性的研究具有重要意义。 本研究分析了来自中国南方和西部两个不同产地的20条罗非鱼群体的mtDNA D-loop区序列，并评估了它们的遗传多样性。首先，我们对D-loop区进行了PCR扩增，并进行了测序和多序列比对。结果显示，所有群体均具有相同的序列长度，且没有插入或删除条件。我们检测到29个单倍型，其中24个单倍型仅出现在一个群体中，而5个单倍型出现在多个群体中。南部群体的单倍型多样性（Hd=0.914）显著高于西部群体（Hd=0.651），并且两个产地的群体中均存在私有单倍型。 进一步的分子进化学分析表明，在两个产地的群体中，单倍型间的遗传距离（FST）比单倍型内部的遗传距离（FSC）显著高，这表明原是进化中存在基因流现象。非参数配对指数分析表明，南部群体和西部群体之间有一定程度的遗传分化（FST=0.104，P＜0.01）。 综上所述，罗非鱼不同群体之间的mtDNA D-loop区遗传多样性比较丰富，南部群体的遗传多样性显著高于西部群体。两个产地之间存在一定的遗传分化，但也存在基因流现象。这些结果有助于更好地了解罗非鱼的遗传多样性及其保护和管理。