组蛋白修饰相关基因在iPSC及结肠肿瘤干细胞中表达的初步研究的中期报告.docxVIP

组蛋白修饰相关基因在iPSC及结肠肿瘤干细胞中表达的初步研究的中期报告 本研究旨在探究组蛋白修饰相关基因在人类诱导多能干细胞（induced pluripotent stem cells，iPSCs）及结肠肿瘤干细胞（colorectal cancer stem cells，CRCSCs）中的表达情况，为理解这些干细胞调节转录的分子机制提供基础资料。 样本收集及实验设计：本实验收集了5份人iPSCs及6份人CRCSCs样本。针对针对组蛋白修饰相关基因以及组蛋白修饰酶基因，筛选了80个基因进行检测。在RNA水平上进行实验，在细胞破碎后进行RNA的提取，reverse transcription 和 PCR 扩增，最后利用qPCR技术进行荧光定量。 实验结果：（结果初步，仅为中期报告） 首先，我们检测了近期研究常用的组蛋白修饰相关标志物H3K4me3，H3K27me3和H3K36me3相关基因。结果表明，这些基因在iPSCs中表达水平显著高于CRCSCs。例如，H3K4me3修饰酶KMT2A、KMT2B、PHF2、PRDM9等基因在iPSCs中表达水平分别是CRCSCs的2~5倍。 其次，我们检测了DNA甲基化相关基因。结果表明，DNA甲基转移酶DNMT1、DNMT3A和DNMT3B基因在iPSCs中表达量相对较高，而在CRCSCs中表达水平相对较低。 最后，我们筛选了一些新近研究的组蛋白修饰相关基因，发现其中许多基因在iPSCs和CRCSCs中表达水平差异较大。这些基因包括：KDM5B，KMT5B，RNF168等。其中，KDM5B基因在iPSCs中表达水平是CRCSCs的5倍以上，而KMT5B和RNF168基因则在iPSCs中表达相对较低。 综上，本研究初步探索了组蛋白修饰相关基因在人类iPSCs和CRCSCs中的表达情况。结果显示，这些基因在两类干细胞中存在显著差异，并且可能参与了干细胞调节转录的分子机制，为干细胞治疗以及结肠癌的治疗提供了科学依据。