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- 2023-11-03 发布于上海
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中国林蛙皮肤活性多肽基因表达的多样性研究的中期报告
本研究旨在探究中国林蛙皮肤活性多肽基因表达的多样性,在中期报告中,我们完成了以下工作:
1. 搜集了中国林蛙不同发育阶段和不同组织的皮肤样本,共计23个样本。
2. 通过RNA提取和测序,获得了高质量的转录组数据,并采用Trinity软件进行拼接和组装,最终得到300,000个转录本。
3. 利用TransDecoder软件对得到的转录本进行预测,获得了81,000个候选编码区序列。
4. 在NCBI和Uniprot数据库中使用Blast进行注释,共获得了46,000个注释序列。
5. 通过比对和聚类,确定了不同样本之间的差异基因,并进行了GO和KEGG分析。
6. 筛选出与皮肤活性多肽相关的基因,利用实时荧光定量PCR技术对其表达水平进行验证。
目前,初步结果显示,中国林蛙发育过程中皮肤活性多肽基因表达呈现出一定的时相性和空间性差异,同时还发现了两个新的皮肤活性多肽基因。我们将进一步深入研究这些基因在中国林蛙生理和病理过程中的作用和调控机制。
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