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基部藓类的分子系统学研究的中期报告 基部藓类是一类原始的陆生植物，其分子系统学研究一直备受关注。本文是基于中期研究成果的报告。 首先，通过对基部藓类11个属下12个物种的叶绿体基因组进行测序和组装，我们获得了这些物种叶绿体基因组的全序列。这些叶绿体基因组大小在97 kb到143 kb之间，其中基部藓类的叶绿体基因组在结构上与其他植物叶绿体基因组类似，包括4个部分：大单括号（LSC）、小单括号（SSC）、反向重复区（IRa和IRb）。 其次，我们使用最大似然法构建了基部藓类物种间的系统发育树，使用了叶绿体基因组上的121个基因作为系统发育分析的依据。结果显示，所有基部藓类物种均聚为一个支系，表明这些物种具有较高的亲缘关系。 此外，我们还对这些物种进行了基于等位基因的种群遗传学分析，以了解它们的遗传多样性和基因流情况。结果显示，这些物种的等位基因丰富度、有效等位基因数量和基因多样性均较高，表明它们具有较高的遗传多样性。基部藓类物种间的基因流情况也比较复杂，存在较多的基因交换事件。 综上所述，我们成功地获取了基部藓类物种叶绿体基因组的全序列，并对这些物种进行了系统发育和种群遗传学研究，为基部藓类的分类和进化提供了新的证据和启示。不过，还需要进一步加强这些物种的野外调查和分子学研究，以加深对它们的了解。