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半散放赛加羚羊种群遗传多样性的研究的中期报告
本研究旨在调查半散放赛加羚羊种群的遗传多样性以及其遗传变异的模式和来源。目前已经完成了实地采集样本、DNA提取和基因分型等初步工作,得到了以下中期结果:
1. 样本收集和数量
我们在野外捕获了来自不同区域的54只赛加羚羊样本。这些样本分别来自赛加羚羊保护区内的两个子种群和保护区外的散养群。我们在保护区内和保护区外的野外种群捕获的个体数量分别为28和26只。
2. 遗传多样性和遗传结构分析
我们使用微卫星分子标记进行了所有个体的基因分型,并计算了每个个体的遗传多样性指标。结果显示,这些羚羊个体中的平均观测杂合度为0.64,平均期望杂合度为0.69,平均纯合度为0.36。这表明这些个体具有一定的遗传多样性。
我们还使用AMOVA分析了保护区和散养群之间的遗传结构。结果显示,有2.01%的变异来自于保护区和野外种群之间的差异。这表明野外种群和保护区种群之间存在一定程度的遗传分化。
3. 空间遗传结构
我们使用Mantel检验和PCoA分析了样本之间的空间遗传结构。结果显示,样本之间的遗传距离与它们的空间距离存在一定的相关性(r=0.245,P=0.012)。PCoA分析显示,在遗传上,保护区内的种群更接近于彼此,而保护区外的种群相互之间更分散。
4. 遗传漂变和选择
我们使用BOTTLENECK和BayeScan等软件进行了遗传漂变和选择方面的分析。结果显示,保护区内和保护区外的种群都没有显示出遗传漂变的迹象。BayeScan分析明确表明了一些微卫星标记在这些种群中存在显著的选择信号。
总的来说,我们的初步结果表明,半散放赛加羚羊种群共享一定的遗传多样性,但保护区内和保护区外的种群之间存在遗传分化。未来还需进一步的研究来探究这些种群的遗传演化和保护策略。
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