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小麦Pm21抗白粉病的差异蛋白质组学的中期报告
本研究旨在分析抗白粉病小麦品种Pm21与敏感品种在蛋白质组学水平的差异,以深入了解Pm21抗性机制。本文介绍了研究的中期结果。
方法
我们从小麦品种Pm21和敏感品种中分别采集叶片样品,经过蛋白质提取、SDS分离、谱带切割、酸解和LC-MS/MS鉴定等步骤,获得了两个品种叶片中的差异蛋白质。
结果
1. 差异蛋白质的鉴定
经过LC-MS/MS鉴定,共鉴定到了843个蛋白质,其中在Pm21中表达的差异蛋白有49个,敏感品种中表达的差异蛋白有55个,共有16个差异蛋白在两个品种中都表达,但表达水平不同。
2. 功能分类分析
差异蛋白经过GO(Gene Ontology)注释和KOG(euKaryotic Ortholog Groups)分析,分类结果显示,两个品种的差异蛋白主要分为可调节蛋白、氧化还原酶、转移酶、抗氧化酶、酶、细胞结构蛋白等多个功能类别。而在差异蛋白中,更多的是氧化还原酶的相关蛋白,这表明氧化应激的响应在Pm21的抗白粉病中与其他功能相关蛋白有很大的区别。
3. 差异蛋白互作网络分析
根据STRING数据库中的信息,可以构建出差异蛋白之间的相互作用网络。在Pm21品种中,共有17个蛋白质构成了网络,而在敏感品种中只有13个蛋白质。网络分析结果发现,氧化还原酶和拟南芥AT3G19730有较多的相互作用关系。
结论
本研究初步分析了抗白粉病小麦品种Pm21与敏感品种在蛋白质组学水平的差异,结果表明差异蛋白主要涉及到了氧化还原酶、可调节蛋白等多个功能类别。此外,氧化应激响应在Pm21的抗病机制中可能有重要的作用。未来将会进一步深入地解析差异蛋白质的生物学功能及调控网络。
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