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基于化学元素标签策略的蛋白质选择性识别和绝对定量方法学研究的中期报告
该研究旨在开发一种基于化学元素标签策略的蛋白质选择性识别和绝对定量方法学。在本次中期报告中,我们介绍了研究前期的实验设计、样品制备和质谱条件优化。
实验设计方面,我们采用人类亚口金融蛋白(hApoF)作为模型蛋白,将其分别与两种化学元素标签(^15N和^114Cd)结合,制备出4个样品(hApoF,hApoF-^15N,hApoF-^114Cd,hApoF-^15N-^114Cd)。采用原位消化和ZipTip清洗纯化方法,获得了高纯度的样品。
质谱条件方面,我们通过Q-Exactive Plus质谱仪进行分析,选用高分辨率MS/MS扫描模式,以及定量分析所需的平行反离子扫描(PRM)技术。针对样品特点和化学元素标签特性,分别进行了毒性和离子信号强度测试,确定了最适宜的碰撞能量和离子注入时间。
下一步,我们将针对标准曲线、选择性识别和绝对定量实验进行进一步实验,并对数据进行分析和解释。我们希望通过本研究的方法学研究,为蛋白质分析领域提供一种新的、高效的定量和鉴定方法。
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