RevBayes的图形处理器算法改进.docxVIP

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2023-11-19 发布于广东
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RevBayes的图形处理器算法改进摘要 RevBayes是继MrBayes之后的又一个用于生物学系统发育推断的程序，它是一个用C++语言编写的开源程序，RevBayes使用自己的语言Rev（一种概率编程语言），它采用马尔可夫链蒙特卡罗（Markov chain Monte Carlo，MCMC）算法来估计系统发育树的后验概率。 DNA测序的飞速发展大大提高了DNA序列的生产量，这对生物学家来说，传统的算法已经不足以应对如此大规模的数据，于是各种并行计算的算法应运而生。本文考虑到图形处理器（GPU）作为一种革新性且并行计算性能良好的技术，提出了对RevBayes进行GPU算法的改进。本文