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- 2023-11-22 发布于上海
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植物中miRNA的计算预测和植物叶片衰老数据库构建的中期报告
本研究的中期报告包括两个方面的内容:植物中miRNA的计算预测和植物叶片衰老数据库的构建。
一、植物中miRNA的计算预测
我们使用基于机器学习方法的miRNA预测软件miRDeep-P2,对不同物种的植物中的miRNA进行预测。目前已经完成了四个物种的miRNA预测工作,分别是拟南芥、水稻、玉米和大豆。预测结果表明,我们能够准确地预测出这些植物中的已知miRNA,并发现了许多新的miRNA,这些新的miRNA将会进一步分析和验证。
二、植物叶片衰老数据库的构建
我们利用已有的转录组数据,对不同物种的植物叶片衰老期间的转录组进行了分析,并筛选出了与叶片衰老相关的基因。目前已经完成了三个物种的转录组分析,分别是小麦、大豆和油菜。根据这些基因的功能注释信息,我们构建了一个植物叶片衰老数据库,该数据库将会为进一步的分析和研究提供有关植物叶片衰老的重要信息。
总之,本研究的中期报告展示了我们在植物中miRNA预测和植物叶片衰老数据库构建方面的进展,这些工作将为后续的深入分析和研究提供有价值的基础数据和资源。
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