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基于RNa-Seq技术分析辣椒素合成相关基因的中期报告 本研究旨在基于RNA-Seq技术，分析与辣椒素（Capsaicin）合成相关的基因在辣椒果实发育过程中的表达情况，并进一步探究其调控机制。 目前，我们已经完成了对辣椒果实发育过程中三个不同时期（15天、30天和45天）的RNA提取、cDNA文库构建和Illumina HiSeq 4000平台的测序工作。经过质控和过滤，得到了大约1.2亿条高质量的clean reads，总共产生了约2.4T的数据量。 在得到的clean reads中，98.5%的reads比对到了Capsicum annuum的参考基因组。基于比对结果，我们使用RSEM软件计算了不同时间点上每个基因的表达量，并采用DESeq2软件进行差异基因分析。结果显示，在不同发育阶段，被检测的基因表达存在显著差异，并且有大量的差异表达基因（DEGs）在辣椒素合成途径中发挥作用。 随着研究的深入，我们将继续利用各种生物信息学方法，来进一步分析DEGs的功能、调控网络以及对辣椒素合成的作用。同时，我们也将与实验室同事共同开展基因敲除和转基因等实验，以验证我们的信息学分析结果，以期提高我们对辣椒素合成调控机制的认识，为辣椒品质改良提供科学依据。