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橡胶树自根幼态无性系与其供体(老态无性系)差异的分子基础研究的开题报告

一、研究背景

橡胶树是热带地区一种重要的经济作物，其胶乳中含有高质量的天然橡胶，是造车、轮胎等行业的重要原材料之一。然而，橡胶树的栽培周期长，生长和发育过程中还存在许多难以解决的问题，如天然胶乳产量低、生长缓慢等。为了解决这些问题，研究橡胶树的生长发育过程，深入了解其植物发育分子基础，对于提高橡胶树的生长质量与胶乳产量具有重要的意义。

二、研究目的

本研究的主要目的是通过比较橡胶树自根幼态无性系与其供体(老态无性系)的RNAseq组学信息，挖掘出两者之间的差异性基因以及差异性基因的功能，并与生长发育过程中的变化相联系，深入了解橡胶树生长发育的分子基础。

三、研究方法

1.土壤种植法，分别选择橡胶树自根幼态无性系与其供体(老态无性系)进行实验。观察和记录两者之间在根粒芽、去皮根、中段根和顶端分生组织等方面的差异。

2.RNAseq测序分析。收集样本RNA，参照指定的流程进行补体DNA的合成，建立测序文库并进行Illumina测序。得到的结果用DESeq2分析平台进行差异基因筛选，通过KEGG、GO等路径注释进行生物学功能分析。

3.技术平台。本实验使用基于PacBioSMRT技术的第三代测序。这种技术可以避免Illumina二代测序中的拼接错配问题，得到更加长序列的数据。

四、预期结果与意义

通过对橡胶