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一种基于CAI和AUP的mRNA序列联合优化方法.pdfVIP

一种基于CAI和AUP的mRNA序列联合优化方法.pdf

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    本发明公开了一种基于CAI和AUP的mRNA序列联合优化方法，涉及mRNA序列优化领域，包括以下步骤：步骤1、收集目标物种的目标mRNA序列和数据表达，并通过分析获得密码子的使用频率和RNA结构信息；步骤2、计算目标mRNA序列的目标CAI值和目标AUP值；步骤3、根据目标mRNA序列的氨基酸序列，使用密码子的偏好和优化算法生成初始mRNA序列；步骤4、优化初始mRNA序列的CAI值和AUP值，获得优化后mRNA序列；在优化过程中，通过平衡初始mRNA序列的CAI值和AUP值找到最佳平衡点；步骤

    (19)国家知识产权局

    (12)发明专利申请

    (10)申请公布号CN117238374A

    (43)申请公布日2023.12.15

    (21)申请号202311187678.0

    (22)申请日2023.09.13

    (71)申请人上海交通大学宁波人工智能研究院

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