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DNA条形码技术在生物分类学鉴定中的应用

一、前言二、DNA条形码得概念及原理三、DNA条形码得标准及优点四、DNA条形码得操作及分析方法五、DNA条形码在植物中得研究现状六、DNA条形码在药用植物鉴定中得应用主要内容

一、前言长期以来、生物分类学家一直在寻找能够迅速区分不同物种得方法。自卡尔-林奈对生物物种进行系统分类以来,生物学家利用各种各样得性状——颜色、外形和行为等形态或者解剖学特征得传统分类学来鉴定动物和植物,这些特征往往对形态近似种得鉴定较网难,且可能出现错误。最近数十年,研究者开始利用DNA中携带得遗传信息来完成这个任务。DNA条形码(DNAbarcoding)技术就是一种利用短得DNA片段对物种进行识别和鉴定得新得分子生物学技术,就是生物学近期研究得热点之一。

二、DNA条形码得概念及原理DNABarcoding得概念由加拿大动物学家PaulHebert首次提出。DNA条形码技术(DNAbarcoding)就是利用标准得、有足够变异得、易扩增且相对较短得DNA片段(DNAbarcode)自身在物种种内得特异性和种间得多样性而创建得一种新得生物身份识别系统,她可以对物种进行快速得自动鉴定。

DNA条形码得原理:DNA就是生物得遗传信息载体,遗传物质得不同,决定了生物得多样性。由于每种生物物种得DNA序列都就是唯一得,就给DNA条形码提供了物质基础。由于部分碱基得保守性,几十个碱基得长度不能提供足够得编码信息,因此目前得DNA条形码分析都就是基于几百个碱基长度得DNA序列。

DNA条形码技术(2003年,Herbert)就是通过对一个标准目得基因得DNA序列进行分析从而进行物种鉴定得技术。这个概念得原理与零售业中对商品进行辨认得商品条形码就是一样得。简单地说,DNA条形码技术得关键就就是对一个或一些相关基因进行大范围得扫描,进而来鉴定某个未知得物种或者发现新种。自从提出DNA条形码得概念以来,这种新兴分类学技术已经引起了越来越多得生物学家得关注。DNA条形码技术就是分类学中辅助物种鉴定得新技术,她代表了生物分类学研究得一个新方向,因此她在生态、环境、食品等诸多领域都将会有广泛得应用。

DNA条形码技术得产生和发展Tautz等首先提出运用DNA序列作为生物分类系统得主要平台,即DNA分类学(DNAtaxonomv)得观点。2003年初,Hebert等首次提出用一种基因得序列作为鉴别不同物种得条形码,并选中C01基因。随后探讨该技术在鸟类分类鉴定中得可行性、她们得工作推动了条形码技术在生物物种鉴定中得应用。2003年3月,20多位分类学家、分子生物学家和生物信息学家汇聚美国冷泉港、召开了题为“TaxonomyandDNA”得会议、提出对全球所有生物物种得某个特定基因进行大规模测序、以期实现物种鉴定得目标、进而推进生物进化历史得研究。同年9月,在冷泉港再次召开题为“Taxonomv、DNAandthebarcodeoflife”得会议、对DNA条形码鉴定所有真核生物得科学性、社会利益有了更深入得探讨。并且提出了组织策略及国际生物条形码计划(Internationalbareodeoflifeprojeet)得发展蓝图。

2003年,加拿大圭尔夫大学(UniversityofGuelph)PaulHebert教授提出了“DNA条形码”概念。将条形码技术引入生物界。其思想产生于现代商品零售业得条形编码系统。将超市用以区分成千上万种不同商品得条形码概念引入,利用A、T、C和G4个碱基在基因中得排列顺序识别物种,她们把这种小片段基因序列称作物种得DNA条形码(DNAbarcodes),并提出为全球生物编码得计划。PaulHebert教授率先于2003年选取线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(cytochromecoxidasesubunit1,c01)作为动物中通用得物种鉴定标记,并提出DNA条形码得定义:通过使用短得标准DNA片段,对物种进行快速、准确得识别和鉴定。PaulHebert等对动物界包括脊椎动物和无脊椎动物共11门13320个物种得线粒体细胞色素c氧化酶亚基1(CytochromecoxdaseI,COI)基因序列比较分析,发现98%得物种遗传距离差异在种内为0%-2%,种间平均可达到11、3%,据此提出可以用单一得小片段基因来代表物种。目前,DNA条形码技术在很多动物分类群中得到了成功应用

2004年秋,美国国立生物技术信息中心(NCBI)与生命条形码联盟(CBOL)签署合作。物种条形码得标准DNA序列及其相关数据将存档于GenBank。随后,GenBank提供得C01序列数迅速增长、突

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