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基于深度学习算法的lncRNA与蛋白质互作预测

摘要

人类基因组中约98%的序列不编码蛋白质,其转录物为非编码RNA(non-codingRNA,ncRNA),在ncRNA中绝大多数是功能涉及生物体内各种生理病理过程的长链非编码RNA(longncRNA,lncRNA)。ncRNA与lncRNA通常通过与绑定蛋白质互相作用来发挥功能,因此程序预测RNA蛋白质互作(RPI)对于理解ncRNA与lncRNA的作用机制有重要意义。

之前预测RPI的研究中对蛋白质与RNA序列的特征编码方式存在局限,而且广泛使用机器学习模型来进行预测。考虑到近些年来深度学习模型成为诸多生物序列相关问题上最有效的方

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