原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
- 5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次， 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
GenomeDataStandards
Version1.0beta,15June2017
TheGenomeWarehouse(GWH)acceptsgenomeassemblyassociated
data,includinggenomeassemblymeta-data,genomesequencedata,
genomeannotationdata,sequenceorderingandorientationinformation
data,andsequenceassignmentdata.
1IDSystem
2FileFormat
2.1Submitteddata
2.1.1Dataformat
2.1.2Dataformatdescription
2.2Downloadeddata
3Metadata
3.1Submitter
3.2Gneralinformation
3.3Genomeassemblyfiles
3.4Sequenceassignment
3.5Reference
4DataAnalysis
4.1Initialvalidationprocessing
4.1.1Genomesequence
4.1.2Genomeannotation
4.1.3Sequenceorderingandorientationinformation
4.1.4Sequenceassignment
4.2Sequencecontaminationprocessing
1IDSystem
GWHaccessionNo.isprefixedwith‘GWH’andisfollowedby4Capital
letters,and8digits.Forexample,GWHAAA
2FileFormat
Therearetwotypesofdatafile,required(*)andoptional(#).
2.1Submitteddata
2.1.1Dataformat
*
Genomesequence:FASTA(Step3Files)
#
Genomeannotation:GFForTBL(Step3Files)
#
Sequenceorderingandorientationinformation:AGP(Step3Files)
Note:requiredifgenomeassemblyisdraftgenomein
scaffold/chromosomelevel.
#
Sequenceassignmentinformation:CSV(Step4Assignment)
Note:requiredifgenomeassemblyiscompletedgenomeordraft
genomeinchromosomelevel.
2.1.2Dataformatdescription
GFFformat
TheGFFfileisusedtodescribegenomeannotationthatcontainsgene
文档评论（0）