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梨树PpSnRK2基因克隆与生物信息学分析
摘要:在前期转录组研究的基础上,挖掘出梨树干旱响应基因PpSnRK2。本研究以‘黄金’梨(Pyrus
pyrifolia‘Niitaka’×P.pyrifolia‘Nijisseiki’)为试验材料,克隆其叶片中PpSnRK2基因,并对其进行生物信息学分析以及在不同土壤水分条件下的表达量进行测定。结果显示:PpSnRK2基因cDNA序列全长1024bp,编码340个氨基酸的蛋白。PpSnRK2蛋白为亲水蛋白,可能靶向细胞质,无跨膜结构,无信号肽,非分泌型蛋白,存在潜在的糖基化位点,17个丝氨酸、8个苏氨酸和7个酪氨酸可能是其蛋白激酶磷酸
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