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苹果EST-SSR引物的开发及部分品种亲缘关系分析的开题报告

1.研究背景和意义

近年来，随着分子生物学技术的发展，基因标记技术在果树遗传育种中得到了广泛应用。其中，EST-SSR（表达序列标记）技术因具有优良的特征，如编码区序列保守性高、多态性丰富、设计和开发易于实现等，已成为果树分子标记技术中的重要组成部分，特别是在遗传育种、种质资源和生物技术等领域得到了广泛的应用。

苹果是世界上的重要果树之一，其多样化的类型和品种在全球种植，并且在人类膳食中具有重要的地位。因此，对苹果品种的亲缘关系研究具有重要的意义，有助于了解不同品种之间的遗传差异和差异程度，促进新品种的选育和传统品种的保护。而EST-SSR技术可以为苹果品种亲缘关系及分类鉴定提供可靠的分子生物学手段。因此，本研究旨在开发苹果EST-SSR引物，并采用该技术进行部分品种的亲缘关系分析和分类鉴定。

2.研究方法

在本研究中，首先采用生物信息学方法从已有的苹果EST序列数据库中选取合适的EST序列，使用特定软件进行比对，选择具有多态性和可靠性的EST-SSR位点，并设计引物。然后利用PCR技术在苹果不同品种中扩增目标位点，最后通过多态性分析、遗传性状分析、亲缘关系分析以及聚类分析等方法进行数据处理和分析，得出品种亲缘关系的结果。

3.预期结果

本研究预计可以开发出若干个具有多态性和可移植性的EST-SSR引物，可以用于苹果品种的分子标记分析和分类鉴定。同时，本研究还将对苹果不同品种之间的亲缘关系和分类进行研究，为苹果的遗传育种和传统品种的保护提供科学依据和参考。

4.参考文献

1.张杨,张晔.EST-SSR技术在苹果遗传资源研究中的应用[J].果树学报,2014,31(1):174-183.

2.翟虎波,王博.EST-SSR技术在果树分子标记中的应用[J].北方园艺,2011,34(22):89-91.

3.肖玥,王继红.EST-SSR分子标记技术在果树分类鉴定中的应用[J].江苏林业科技,2017,44(3):36-40.