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结合偏最小二乘回归的复杂疾病基因定位全基因组关联分析的开题报告

题目：结合偏最小二乘回归的复杂疾病基因定位全基因组关联分析

一、研究背景

针对复杂疾病的发病机制目前尚不完全清楚，但已有研究表明遗传因素在其中起到了关键作用。全基因组关联分析（GWAS）是一种常用的遗传学研究方法，可以通过检测大规模样本中基因和疾病之间的关联来确定与疾病相关的基因。在实际应用中，GWAS存在多重比较校正后功效不足、环境因素影响难以消除等问题。因此，如何在GWAS中准确地定位复杂疾病的相关基因是当前遗传学研究领域的重要问题之一。

二、研究内容和方法

本研究旨在结合偏最小二乘回归（PLSR）和GWAS来定位复杂疾病的相关基因。PLSR是一种线性多元回归方法，旨在将预测变量与响应变量之间的相关性最大化。相比传统的单元素回归，PLSR能够同时处理多个预测变量和响应变量，并减少多重比较的问题。本研究将会采用PLSR与GWAS相结合的方法，通过对多个基因突变和环境因素进行综合分析，通过筛选出与复杂疾病发病相关的基因。

三、研究意义

本研究通过新的分析方法，可以有效减少在GWAS中多重比较问题所带来的损失，提高了定位复杂疾病相关基因的准确性和效率，对明确复杂疾病的发病机制，找出与疾病相关的基因具有重要的意义和应用价值。

四、研究计划和进度

1、收集和整理研究所需的数据集并进行预处理。

2、PLSR回归模型的构建，通过交叉验证和优化算法，选择最优的预测变量和响应变量。

3、进行GWAS分析，通过PLSR筛选出相关基因。

4、进行生物信息学分析，确定筛选出的基因与复杂疾病之间的关系，并探究其可能的作用机制。

5、撰写论文并完成毕业设计。

预计完成时间：2022年6月。