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第44卷第3期河南师范大学学报(自然科学版)Z.44No.3
2016年5月JournalofHenanNormalUniversity(NaturalScienceEdition)May2016
文章编号:1O0O一2367(2016)03—0140—06
分子标记技术在作物育种中的应用与展望
李元龙,王中华
(西北农林科技大学农学院,陕西杨凌712100)
摘要:回顾分子标记的发展,介绍了一些有代表性的分子标记在生态学,聚类分析,品种差异性分析以及分
子育种中等多方面的应用,并总结了它们的优缺点.随着深度测序技术的发展和多种序列信息库的完善,预测了未
来分子标记的发展方向——功能性分子标记(Functionalmolecularmarker),这种新型的分子标记技术利用了基因中
的一些功能元件或者重要的单碱基多态性(SNP)位点,提高了在应用中的分辨率和灵敏度.
关键词:分子标记;单碱基多态性(SNP);功能标记;作物育种
中图分类号:$565文献标志码:A
自从第一代分子标记——RFLP分子标记问世以来,越来越多的分子标记被开发出来,如RFLP,
RAPD,AFLP,SSR等,这些分子标记应用于种质资源的评估、系统发育、进化分析以及QTL定位中.然
而,早期大多数分子标记都是位于基因的非编码区和非调控区,为中性标记.而在实际的育种工作中,往往需
要针对作物的某一经济性状展开,如大豆的蛋白含量,油料含量,粒重等口].这就需要开发出更加有效、准
确的与基因功能相关联的分子标记.随着作物基因组、转录组、蛋白组信息越来越详细以及多种作物基因功
能研究的深入,更高灵敏度和特异性的功能性分子标记(FunctionalMarker)被开发出来,这将是未来分子标
记的发展方向.
1RFLP与T—RFLP技术
限制性片段长度多态性(restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)标记是最早开发的DNA标
记技术_4],借助限制性内切酶切割基因组,获得具有多态性的DNA片段,利用Southern印迹转移到硝酸纤
维膜上,用放射性DNA探针来显示膜上DNA片段的多态性图谱.最终表现出不同个体间序列信息的差异.
RFLP属于共显性标记,在构建遗传图谱时,具有不受非等位基因间上位作用的影响的优点,但由于RFLP
的步骤烦琐、周期长,渐渐不适用于现代分子育种研究.不过,现在仍可应用于比较基因组学的研究.KeimP
等使用17个RFLP分子标记针对大豆属中的两大亚属,栽培大豆亚属(Glycinemax(Linnaeus)Merril)和
野生大豆亚属(GlycinesojaSieb.etZucc)进行了基因组差异性分析,结果发现在栽培大豆亚属内的品种之
间的基因组差异是最小的[5].而在野生大豆亚属中各品种间基因组有明显的差异,MenancioDI等用RFLP
方法分析了7个野生大豆种之间的亲缘关系和变化,研究发现野生大豆种(GlycinetabacinaBenth.)和另一
野生大豆种(GlycineclandestineWend1.)之间基因组差异最明显,从进化来源上分析,这种差异性是从野生
大豆亚属(GlycinesojaSieb.etZucc)开始慢慢分离的,并最终形成了两个不同的种].可见RFLP分子标
记技术在揭示遗传层面上的物种演化和起源方面有着重要的意义.
在RFLP技术的基础上,末端限制性片段长度多样性(Terminalrestrictionfragmentlengthpolymorph一
收稿日期:2015-12—25;修回日期:2016—03—2O.
基金项目:陕西省重点科技创新团队计划项目(2O14KCT一2S)
第1作者简介:李元龙(1992一),男,河南新乡人,西北农林科技大学硕士研究生,研究方向为作物遗传育种,E-mail
845686931@qq.com.
通信作者:王中华(1969一),西北农林科技大学博士生导师,教授,研究
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