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本发明公开了基于外源DNA插入突变导致的优势克隆的检测方法,对病毒IS信息数据进行正负链矫正、冗余整合的预处理;步骤2、在预处理完成后,对非特异性扩增造成的IS进行识别,以去除因PCR非特异扩增引起的假阳性IS检测结果;步骤3、根据位点聚类算法对临近位置的IS进行合并,并聚类;步骤4、根据聚类结果对克隆平面进行分析,并对优势克隆进行描述;本发明利用PCR引物相似性排名算法,对可能的PCR引物相似性导致的非特异性扩增进行识别和去除,在实际应用中显著降低IS识别的假阳性,提升准确率。
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN117746982A
(43)申请公布日2024.03.22
(21)申请号202311733844.2
(22)申请日2023.12.15
(71)申请人上海唯可生物科技有限公司
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