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- 2024-04-06 发布于上海
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大豆疫霉侵染早期机制的分子解析的任务书
任务背景:
大豆是世界上最重要的油料作物之一,其主要生产国家有美国、巴西、阿根廷等,且中国是大豆进口量最大的国家。然而,大豆生长过程中容易受到多种病原菌感染,其中疫霉是常见的侵染病菌之一。疫霉的侵染不仅会导致大豆减产,影响经济效益,而且还会引发一系列食品中毒问题,对人体健康产生威胁。
大豆疫霉侵染的早期机制的分子解析,有助于深入了解大豆疫霉侵染的分子机理及相关调控网络,为疫霉病害的抵抗和控制提供科学依据。因此,本任务旨在对大豆疫霉侵染的早期机制进行分子解析,并尝试挖掘相关调控网络。
任务目标:
1.确定大豆疫霉侵染的早期时间点。
2.对大豆根部进行RNA特异性测序,获取疫霉侵染前后的基因表达谱,筛选差异表达基因,分析其生物学功能。
3.进行差异基因富集分析和基因互作网络分析,挖掘相关调控网络,并验证其在大豆疫霉侵染中的作用。
4.结合生物信息学工具对差异表达基因进行GO功能分类、KEGG通路分析等,分析这些基因的相关功能及通路。
5.尝试验证挖掘的重要调控基因在大豆疫霉侵染中的作用机制及其在疫霉病害的抵抗和控制中的潜在应用。
任务计划:
第一阶段(1个月):确定大豆疫霉侵染的早期时间点。
第二阶段(2个月):对大豆根部进行RNA特异性测序,获取疫霉侵染前后的基因表达谱,筛选差异表达基因,分析其生物学功能。
第三阶段(2个月):进行差异基因富集分析和基因互作网络分析,挖掘相关调控网络,并验证其在大豆疫霉侵染中的作用。
第四阶段(1个月):结合生物信息学工具对差异表达基因进行GO功能分类、KEGG通路分析等,分析这些基因的相关功能及通路。
第五阶段(1个月):尝试验证挖掘的重要调控基因在大豆疫霉侵染中的作用机制及其在疫霉病害的抵抗和控制中的潜在应用。
任务成果:
1.大豆疫霉侵染的早期机制分子解析报告。
2.大豆疫霉侵染前后基因表达谱和差异表达基因列表。
3.差异基因富集分析和基因互作网络分析报告。
4.GO功能分类和KEGG通路分析结果报告。
5.重要调控基因验证结果报告。
6.相关数据和文献资料。
任务团队:
1.任务负责人:1名,负责任务的整体策划和组织实施。
2.生物信息专家:1名,负责数据分析和挖掘相关调控网络。
3.分子生物学专家:1名,负责实验方案设计、试验操作等。
4.病理学专家:1名,负责样品处理及病理学分析。
任务经费:
本任务经费总计为30万元,其中包括:
1.实验耗材费:10万元。
2.实验设备费:10万元。
3.人员费用:6万元。
4.办公及实验场地费:4万元。
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