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MRSA分子分型新方法SMT的评估及MLVF改良方法的建立与验证的开题报告

题目：MRSA分子分型新方法SMT的评估及MLVF改良方法的建立与验证

背景及意义：

随着社会经济的发展和全球交往的加剧，细菌耐药性问题已经成为全球性的公共卫生问题。耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MethicillinResistantStaphylococcusaureus，MRSA）是一种常见的医院感染病原菌，在临床上难以治疗。因此，研究MRSA的分子流行病学和分子诊断方法是非常必要的。

当前，常用的MRSA分型方法包括多重位点序列分析（Multi-LocusSequenceTyping，MLST）、spa基因序列分析等，虽然这些方法在理论上是可行的，但是实际操作过程中存在一些问题，比如样本准备工作繁琐、操作复杂、结果不稳定等。因此，需要研究新的分子分型方法。

同时，在常用的分子分型方法中，MLST和spa序列分析的鉴定结果有时存在冗余性或者重复性，难以准确地判定样品的来源和流行病学信息。因此，需要对MLVF（Multiple-LocusVariable-numbertandemrepeatAnalysis）方法进行改良，提高其准确性。

研究内容：

本研究将探讨基于SMT（SNPMultilocusTyping）的MRSA分子分型新方法，并评估其在MRSA流行病学研究中的应用性和可行性。同时，本研究还将尝试对MLVF方法进行改良，以提高其鉴定结果的准确性。

具体研究内容包括以下几个方面：

1.收集MRSA菌株样本，并进行基础实验室处理及分离纯化等预实验工作。

2.进行SMT方法的优化，包括SNP位点的选定、引物的设计、扩增反应的条件控制等。

3.对已有的MLVF方法进行改良，尝试修正其操作步骤，以提高鉴定结果的准确性。

4.对SMT方法和改良后的MLVF方法进行初步评估，包括谱系分化、流行病学特征鉴定等指标。

5.验证结果，包括SMT方法的重现性、稳定性、可靠性，以及改良后的MLVF方法鉴定结果的可信度和准确性等方面。

研究意义与创新点：

本研究将建立和优化分子分型方法，对MRSA的流行病学研究有着重要的指导意义，同时也为临床上的疾病预防和控制提供技术支持。本研究的创新点在于：

1.基于SMT的MRSA分子分型新方法的建立，不仅能够大大简化操作流程，提高分子检测的准确性和效率，而且能够为MRSA的追踪和防控提供更为精准的分子标记。

2.对现有的MLVF方法进行提高和改良，以提高其鉴定结果的准确性和可靠性，同时也可以适用于其他临床菌株的分型。

3.本研究将评估两种方法在MRSA分子流行病学研究中的应用性和可行性，为MRSA病原菌的预防和控制提供科学依据。

预期成果:

1.基于SMT的MRSA分子分型新方法的建立和优化，以及对MLVF方法的改良方法的建立。

2.对两种方法在MRSA分子流行病学研究中的应用性和可行性的初步评估。

3.一篇高质量的学术论文，并向相关领域的同行和学者发布研究成果。

时间安排：

本研究拟在两年内完成，具体时间安排如下：

第一年：进行样本收集、实验室处理等预实验工作，进行SMT方法和MLVF方法的建立和优化。

第二年：对两种方法进行初步评估，并对评估结果进行统计分析和验证，撰写学术论文。

参考文献：

1.RobinsonDA,KearnsAM,HolmesA,etal.,Re-emergenceofearlypandemicStaphylococcusaureusasacommunity-acquiredmeticillin-resistantclone.Lancet2005;365:1256-1258.

2.EnrightMC,RobinsonDA,RandleG,etal.,Theevolutionaryhistoryofmethicillin-resistantStaphylococcusaureus(MRSA).ProcNatlAcadSciUSA2002;99:7687-7692.

3.SabatAJ,BudimirA,NashevD,etal.,Overviewofmoleculartypingmethodsforoutbreakdetectionandepidemiologicalsurveillance.EuroSurveill2013;18:20380.