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本发明提供基于超图神经网络的药物‑标靶相互作用预测方法,首先从公开数据库上搜集药物‑标靶相互作用信息作为数据集,将获得的数据集分为训练集和测试集,利用训练集中的数据构建用于建模的异质生物网络,然后对异质生物网络进行建模获得异质生物超图,根据获得的异质生物超图生成其对偶超图,再利用超图神经网络进行药物、标靶特征提取,生成药物嵌入和标靶嵌入,最后计算药物和标靶之间相互作用的概率。本发明技术方案将异质生物网络建模为超图,可以充分学习药物和标靶间的高阶复杂关系,带来更好的预测效果。
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN112070277A
(43)申请公布日2020.12.11
(21)申请号202010824732.8G16H70/40(2018.01)
(22)申请日2
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