《红松无性系SSR鉴别技术规程》.pdfVIP

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ICS65.020.01

CCSB61

DB23

黑龙江省地方标准

DB23/TXXXX—XXXX

红松无性系SSR鉴别技术规程

(征求意见稿)

主要起草单位:东北林业大学

联系人:张含国

联系电话

邮箱:hanguozhang1@

XXXX-XX-XX发布XXXX-XX-XX实施

黑龙江省市场监督管理局发布

DB23/TXXXX—XXXX

红松无性系SSR鉴别技术规程

1范围

本标准规定了利用简单重复序列(Simplesequencerepeat,SSR)对红松(Pinuskoraiensis)无性系鉴别

技术规程的范围、规范性引用文件、术语和定义、仪器设备及试剂、溶液配制、引物信息、操作程序、数

据记录与统计、判定规则。

本标准适用于红松无性系的SSR指纹数据采集及品种鉴定,家系等可参考本标准。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。

凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改章节)适用于本文件。

GB/T6682中国实验室用水国家标准

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

3.1

红松无性系

从红松天然群体或人工杂交、诱变群体中,选择优良单株,通过无性繁殖得到的红松品系。

3.2

参照无性系

具有SSR位点上不同等位变异的红松无性系,用于辅助确定送检样品的等位变异,校正仪器设备的系

统误差。

3.3

核心引物

红松无性系鉴定中优先选用的一套SSR引物,具有多态性高、重复性好等综合特性。

4技术原理

由于不同红松无性系遗传组成不同,基因组DNA中简单重复序列的重复次数存在广泛差异,这种差

异可以通过PCR扩展及电泳方法进行检测,从而能够区分不同红松无性系。

5仪器设备及试剂

见附录A。

6溶液配制

见附录B。

7引物信息

1

DB23/TXXXX—XXXX

核心引物名单及序列见附录C。

8操作程序

8.1样品制备

送检样品宜为一年生针叶,-80℃超低温冷冻保存。同一红松无性系样品数应大于5个。

8.2DNA提取

CTAB提取法:新鲜针叶200mg~300mg,置于研钵中,加液氮充分研磨,移入2.0mL离心管;每管

加入700μL65℃预热的CTAB提取液后,充分混合,65℃保温60min期间多次颠倒混匀;每管加入等体

积的三氯甲烷/异戊醇混合液,充分混合后,静置10min;12000g离心15min后,吸取上清液至一新离心

管,再加入等体积预冷的异丙醇,颠倒离心管数次,在-20℃放置30min;4℃,12000g离心10min,弃上

清液;加入70%乙醇,旋转离心管数次,弃去乙醇;将离心管倒立于热有滤纸的实验台上,室温干燥沉淀;

加入100μL超纯水或TE缓冲液,1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量,并进行浓度测定,稀释至20ng/μL

充分溶解后备用。

试剂盒提取法:使用经验证适合SSR指纹技术的商业试剂盒,按照试剂盒的使用说明操作。

8.3PCR扩增

8.3.1引物选择

应选

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