blast数据库检索最新完整版本.pptVIP

得分有两个：274是原始分，也就是根据打分矩阵计算得到的分数，248是比特分，是归一化的分数，这样可以忽略打分矩阵和的影响。(1)得到并输入查询序列(2)选择BLAST程序(3)选择搜索的数据库(4)选项选择Thenclick“BLAST”/Blast.cgi程序 输入 数据库 blastn DNA 1 DNA blastp protein 1 protein blastx DNA 6 protein tblastn protein 6 DNA tblastx DNA 36 DNA三、BLAST一般使用方法(1)得到并输入查询序列(2)选择BLAST程序(3)选择搜索的数据库(4)选项选择Thenclick“BLAST”可以输入序列的ACCN号，gi号或者FASTA格式的序列点红圈的“more”可以更多的说明1）FASTA格式/BLAST/blastcgihelp.shtml“”开始的单行加分行的序列字符串，中间不允许空行。gi|129295|sp|P01013|OVAX_CHICKGENEXPROTEIN(OVALBUMIN-RELATED)QIKDLLVSSSTDLDTTLVLVNAIYFKGMWKTAFNAEDTREMPFHVTKQESKPVQMMCMNNSFNVATLPAEKMKILELPFASGDLSMLVLLPDEVSDLERIEKTINFEKLTEWTNPNTMEKRRVKVYLPQMKIEEKYNLTSQIKDLLVSSSTDLDTTLVLVNAIYFKGMWKTAFNAEDTREMPFHVTKQESKPVQMMCMNNSFNVATLPAEKMKILELPFASGDLSMLVLLPDEVSDLERIEKTINFEKLTEWTNPNTMEKRRVKVYLPQMKIEEKYNLTSVLMALGMTDLFIPSANLTGISSAESLKISQAVHGAFMELSEDGIEMAGSTGVIEDIKHSPESEQFRADHPFLFLIKHNPTNTIVYFGRYWSP没有开始的带“”的单行，只有序列数据，中间不允许空行。也可以是GBFF格式中的序列数据，即可以带数字和空格，但序列中间也不允许空行。1qikdllvssstdldttlvlvnaiyfkgmwktafnaedtrempfhvtkqeskpvqmmcmnn61sfnvatlpaekmkilelpfasgdlsmlvllpdevsdleriektinfekltewtnpntmek121rrvkvylpqmkieekynltsvlmalgmtdlfipsanltgissaeslkisqavhgafmels181edgiemagstgviedikhspeseqfradhpflflikhnptntivyfgrywsp包括检索号，带版本号的检索号以及gi号都是允许的，但是格式有要求，下面是几种错误的格式。例如“From”中填“20”，“To”中填“200”，那么就是只比对序列中第20个字符到第200个字符之间的子序列（181个字符），如果序列长度小于200，则取到序列长度。三、BLAST一般使用方法(1)得到并输入查询序列(2)选择BLAST程序(3)选择搜索的数据库(4)选项选择Thenclick“BLAST”非冗余数据库Blastn可以比对短的近似精确的序列比对/blast/producttable.shtml#tab31MEGABLASTisthetoolofchoicetoidentifyanucleotidesequence。寻找和被比对序列高度相似的序列，其他的程序discontiguous-megablast和blastn也能实现这个目标，但是MEGABLAST是专门针对高度相似序列而设计的，是最有效的查找和原序列相同序列的工具。DiscontiguousMEGABLASTisbetteratfindingnucleotidesequencessimilar,butnotidentical,toyournucleotidequery。Discontiguousmegablast则更适合发现和被查询序列相似而不是相同的序列。三、BLAST一般使用方法(1)得到并输入查询序列(2)选择BLA