circrna研究进展综述.ppt

CircRNA研究进展分享分享人：滕飞部门：癌症业务线-转录组1编辑课件ppt

目录CircRNA介绍CircRNA研究进展CircRNA文章典型案例分析CircRNA目前生物信息分析流程比较CircRNA未来研究方向预测1979年洛克菲勒大学的Hsu和Coca-Prados在电子显微镜下观察到的真核细胞细胞质中观测到环状RNA的存在2编辑课件ppt

CircRNAcircRNAs（CircularRNAs，环形RNA分子）是一类不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子RNaseRcircRNA具体特征：(1)circRNA由特殊的可变剪切产生，大量存在于真核细胞的细胞质中，但少部分内含子来源的circRNA则存在于核酸内，具有一定的组织、时序和疾病特异性;(2)广泛存在于人体细胞中，有时甚至超过它们线性异构体的10倍之多;(3)与传统的线型RNA(linearRNA，含5＇和3＇末端)不同，circRNA分子呈封闭环状结构，不易被核酸外切酶RNaseR降解，比线性RNA更稳定;(4)具有高度保守性，部分具有快速的进化性改变;(5)大多数来源于外显子，少部分由内含子直接环化形成;(6)部分circRNA分子含miRNA应答元件(miRNAresponseelement，MRE)，可充当竞争性内源RNA(competingendogenousRNA，ceRNA)，与miRNA结合，在细胞中起到miRNA海绵的作用，进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达水平;(7)可以翻译成蛋白质，但大部分是非编码RNA。3编辑课件ppt

CircRNA分类标准：来源exoncircRNA定位：细胞质功能：miRNA海绵作用CiRNAEIciRNAs形成来源4编辑课件ppt

功能：circRNA顺式调控亲本基因的表达一方面circRNA可以与RNA结合蛋白相互结合影响亲本基因mRNA的表达。另一方面，环状RNA形成过程中内含子间竞争性互补配对可以与线性RNA之间达成一种平衡，影响mRNA的表达，甚至蛋白翻译。5编辑课件ppt

功能：海绵作用miRNA海绵作用（miRNAsponge）：结合并封闭miRNA的调控作用，从而使其靶基因表达增强。海绵作用来源6编辑课件ppt

功能：编码蛋白质大多数circRNA存在于胞质中,提示它们可以被装载到核糖体而被翻译成多肽。与许多没有5'帽和3'多聚（A）尾的线性mRNA相似，circRNA也缺乏有效的翻译起始结构，但是一旦启动了一个内部核糖体进入位点（internalribosomeentrysite,IRES）,两者都是可以被翻译的.丁型肝炎病毒（hepatitisDvirus,HDV）的核心包含有单股负链共价闭合circRNA分子，它编码的相关蛋白HDV抗原（hepatitisDvirusantigen,HDAg）在疾病发展中起到了重要的作用.另外，研究者发现，人骨肉瘤细胞U2OS中，circRNA具有翻译功能，尽管其翻译效率非常低.但是，随着越来越多核糖体分析数据的获得，circRNA在其它细胞类型或物种中是否能被翻译是一个值得深入研究的课题7编辑课件ppt

形成机制1.“内含子配对驱动环化”（intron-pair-drivencircularization）模型，2.“套索驱动环化”（lariat-drivencircularization）模型Xiao-Ou.ComplementarySequence-MediatedExonCircularization.Cell,September18,2014;DOI:10.1016/j.cell.2014.09.001套索驱动环化8编辑课件ppt

哈佛医学院Salmena等于2011年7月提出了着名的ceRNA调控假说。该假说认为：ceRNA的生物学功能是通过miRNA应答元件（miRNAresponseelement,MRE）完成的，ceRNA具有数量和种类不等的MRE,可以竞争性地结合miRNA,降低miRNA对其靶标的抑制作用，也就是miRNA的海绵作用。2012年第一篇环状RNA文章（Salzman，2012）发表，Salzman通过RNA-Seq方法首次报道了80个环状RNA。至此借助于高通量测序技术，环状RNA(circularRNA)验明正身进入科研视界，送出了来自这一环状宇宙的第一份信函Jeck等在