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第一章
RNA生物合成;转录基本特点
转录条件
原核生物转录
真核生物转录
RNA转录产物加工
RNA复制;RNA生物合成两种方式
转录:DNA指导RNA合成,生物体内主要合成方式。
RNA复制:RNA指导RNA合成,常见于病毒。
RNA前体(RNAprecursor):转录产生初级转录本,需经加工为成熟RNA后才含有生物学活性与功效。;不对称转录(asymmetrictranscription):转录时,只以双链DNA中一条链作为模板进行转录,将遗传信息由DNA传递给RNA现象。;模板链(templatestrand)及反(无)意链(antisensestrand):指导RNA合成DNA链,又称为负链(-链)。
编码链(codingstrand)及有意链(sensestrand):不作为转录模板另一条DNA链,又称为正链(+链)。
有意链与反意链并非固定不变。;转录连续性
RNA转录合成时,以DNA作为模板,在RNA聚合酶催化下,从头连续合成一段RNA链(不需要引物),各条RNA链之间无需再进行连接。
单顺反子:合成RNA中只含一个基因遗传信息。
多顺反子:合成RNA中含有几个基因遗传信息。;转录单向性:RNA转录合成时,只能向一个方向进行聚合,所依赖模板DNA链方向为3’→5’,而RNA链合成方向为5’→3’。
转录不需要引物;转录起点(startpoint):与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上碱基,此点通惯用+1表示;
上游(upstream):转录起点前面(5’末端)序列,用负数表示;
下游(downstream):转录起点后面(3’末端)序列,用正数表示。;;第二节转录条件;三、RNA聚合酶;大肠杆菌RNA聚合酶
每个细胞中约有3000个RNA聚合酶分子;
组成:全酶由2个α、β、β’、?、σ5种亚基组成,椭圆球形,可结合约60个核苷酸;;关键酶:没有σ亚基酶,只催化RNA链延长,对转录起始无作用;;;真核生物RNA聚合酶
三种RNA聚合酶:Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ。
每个酶分子有两个大亚基,还有10个左右小亚基。
RNA聚合酶Ⅰ:位于核仁中,活性最显著,负责转录rRNA基因。
RNA聚合酶Ⅲ:负责合成tRNA和核内小RNAs,其活性可被高浓度α-鹅膏蕈碱所快速抑制。
RNA聚合酶Ⅱ:位于核浆中,负责hnRNA(mRNA前体)合成,其活性可被低浓度α-鹅膏蕈碱所快速抑制。;由8~14个亚基组成,分子质量为500KDa。;CTD去磷酸化:RNA聚合酶II易与DNA结合,这种构象适于转录起始;
CTD磷酸化:可使RNA聚合酶II与DNA结合变得松弛,形成适于延伸构象。;噬菌体RNA聚合酶
仅由一条多肽链组成;
合成速度很快,在37℃时可达约200核苷酸/秒;
噬菌体RNA聚合酶只能识别噬菌体本身所含有开启子,不能识别其它开启子。
线粒体和叶绿体中RNA聚合酶
和细胞核中酶完全不一样,分子较小。
类似于噬菌体RNA聚合酶。;抑制剂;;开启子共同次序:是开启子关键部位,在RNA转录起点上游大约10bp和35bp处有两个共同次序(-10和-35序列)
-35区:T85T83G81A61C69A52(-35bp,-35序列)
-10区:T89A89T50A65A65T100(-10bp,-10序列)
-35序列:RNA聚合酶全酶识别位点,对全酶有很高亲和性,提供RNA聚合酶识别信号。
-10序列:又称TATA盒(Pribnowbox),是RNA聚合酶全酶紧密结合位点,有利于DNA局部双链解开,决定着双链解开速度和转录方向。;开始转录;;;;;上游开启子元件(upstreampromoterelement,UPE):又称上游激活序列(upstreamactivatingsequence,UAS)位于关键开启子上游,主要包含CAAT框和GC框,各自保守序列与结合蛋白因子各不相同,其功效是控制转录起始频率。
CAAT框:位于上游-70~-80区,其保守序列为GG
CCAATCT;
GC框:位于-80~-110区,其保守序列为GGGGC
GG,是转录因子SP1结合位点。;增强子(enhancer):增强真核生物开启子活性DNA次序。长约100~200bp,其关键组件常为8~12bp,能够单拷贝或多拷贝串联形式存在。;缄默子(silencer):抑制基因表示活性DNA序列,起与调控蛋白结合后可抑制转录起始复合物活化;其作用不受距离和取向限制。
应答元件:真核细胞DNA上存在能对特定环境原因作出应答反应DNA序列。能专一结合特异性蛋白因子,从而调控基因特异表示,如:糖
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