第五章连锁遗传分析.ppt

*②交换率（值）与重组率（值）的关系交换是指遗传物质的局部互换，而重组则是交换后形成基因的重新组合。交换的遗传学效应体现在重组体中，但无法检测其实际大小，只能用重组率来估计，只有紧密连锁的基因间的重组率才是可靠的交换值，因为两个连锁基因间的相对距离越大，发生双交换或其他偶数次交换的可能性越多，在这种情况下，重组率会低估交换率。*③重组率的测定以玉米测交实验为例：支配玉米籽粒的两对基因连锁，糊粉层有色（C）对无色（c）为显性，籽粒饱满（Sh）对凹陷（sh）为显性。互引相：不同对显性基因/隐性基因相互连锁在一起的基因型结构互斥相：不同对显性基因和隐性基因相互连锁在一起的结构**取亲本植株互引相（couplingphase）CSh/CSh与csh/csh杂交，其F1与双隐性亲本测交，结果如下：重组率(RF)=(149+152)/(4032+4035+149+152)＝301/8368＝3.6%*如果杂交在互斥相（repulsionphase）cSh／cSh×Csh／Csh间进行，测交后得到：重组率（RF）＝1310／44595＝2.94%可见，无论哪种基因组合（互引相或互斥相）的交配方式，测交结果都是亲本型频率很高，占97%左右，重组型的频率很低，仅占3%左右。显然，测得的两个特定基因座的RF值越大（接近50%），基因间的连锁关系越难以判断，因为与基因自由组合时的测交比1:1:1:1很接近，这种情况下，必须利用大量的测交后代的数据方可鉴别。如RF值越小，则基因间的连锁关系越易鉴别,因为测交比率与1:1:1：1相差甚远。（2）多线交换与最大交换值在同源染色体的两个连锁的基因之间。如果只出现一个交叉，它只涉及四条染色单体中的任何两条非姐妹染色单体，即四条染色单体中只有两条是以交换的，两条是未交换的，重组型占1/2。两对连锁基因的最大交换值是50%，当两基因间的重组值结晶50%时或是两基因自由组合，或两连锁基因在染色体上相距较远。发生双交换的概率显著低于单交换的概率。**对于二线（two-strand）双交换。产生的四条染色单体对两个座位来说都是亲本型。对于三线双交换（three-stranddoublecrossover）（双交换出现在四条染色单体中的三条中），产生两个亲本型和两个重组型。对于四线双交换（Four-stranddoublecrossover）产生的四条染色单体都是重组类型。★将所有可能的双交换类型综合在一起进行考虑，对于两个基因位点来说50％的产物是重组子。*单交换*5.6染色体作图5.6.1基因直线排列原理及其相关概念5.6.2基因定位的方法5.6.3遗传干涉与并发系数5.6.4利用作图函数计算大图距*5.6.1基因直线排列原理及其相关概念①基因定位（genemapping，genelocalization）:确定基因在染色体上的相对位置和排列顺序的过程。②染色体图（chromosomemap）:又称连锁图（linkagemap）或遗传图（geneticmap）。依据测交实验所得重组值及其他方法确定连锁基因或遗传标记在染色体上相对位置的线性图。*③图距（mapdistance）：两个连锁基因在染色体图上相对距离的数量单位称为图距。1%重组率去掉其百分率的数值定义为一个图距单位（mapunit，mu）。为纪念现代遗传学的奠基人T.H.Morgan，将图距单位称为厘摩（centimorgan，cM），1cM＝1%重组率去掉%的数值。④基因的直线排列早期人们认为基因在染色体上的位置是相对恒定的。其依据是两个基因的重组率的相对恒定性。不同基因间的重组率却是不同的。重组率的大小直接反应着基因在染色体上相对距离的远近。因此，人们就有可能根据基因彼此之间的重组率来确定它们在染色体上的相对位置。为此。至少同时要考虑三个基因座之间的交换重组的关系。若a,b,c基因连锁,已分别测得a-b和b-c间的距离。那么a-c间的距离，就必然等于a-b及b-c距离之和或差。这便是摩尔根的学生A.H.Sturtevant首先提出的基因直线排列原理。**5.6.2基因定位的方法●基因定位：确定基因在染色体上的位置。确定基因的位置主要是确定基因之间的距离和顺序，它们之间的距离用交换值