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(二)伯杰氏系统细菌学手册(Bergey’sManualofSystematicBacteriology)第一版1984年问世,至1989年出齐,共4卷。第二版由GeorgeGarrity主编分为5卷,将从2000年起陆续出版。这一版纳入了研究核糖体RNA测序所产生的许发育)分类系统。第31页,共58页,2024年2月25日,星期天《伯杰氏系统细菌学手册》第二版分古细菌和真细菌2个界,下设18门、27纲、73目、186科,包括870余属和4900多个种。第32页,共58页,2024年2月25日,星期天界Ⅰ:古细菌(Archaeota)部1:热变形菌、硫化叶菌、嗜压菌(Thermoprotei、Sulfolobi、Barophiles,21属36种)部2:产甲烷菌(Methanogens,21属97种)部3:盐杆菌(Halobacteria,14属50种)部4:热原体(Thermoplasma,2属4种)部5:热球菌(Thermococci,5属19种)第33页,共58页,2024年2月25日,星期天界Ⅱ:真细菌(Bacteria)部6:产液菌(Aquifex)和相关细菌(3属5种)部7:栖热袍菌(Thermotoga)和Geotogas,9属22种)部8:异常球菌(Deinococci,1属8种)部9:栖热菌和归属不明的属(Thermi,10属21种)部10:产菌黄(Chrysiongenes,1属2种)部11:绿屈挠菌和滑柱菌(Chloroflexi和Herpetosiphons,5属11种)第34页,共58页,2024年2月25日,星期天界Ⅱ:真细菌(Bacteria)部12:热微菌(Thermomicrobia,1属2种)部13:蓝细菌(Cyanobacteria,69属73种)部14:绿菌(Chlorobia,6属17种)部15:α-变形细菌(α-Proteobacteria,117属392种)部16:β-变形细菌(β-Proteobacteria,53属204种)第35页,共58页,2024年2月25日,星期天界Ⅱ:真细菌(Bacteria)部17:γ-变形细菌(γ-Proteobacteria,150属854种)部18:δ-变形细菌(δ-Proteobacteria,39属128种)部19:ε-变形细菌(ε-Proteobacteria,6属56种)部20:梭菌(Clostridia)和相关细菌(73属403种)部21:柔膜菌(Mollicutes,10属191种)部22:芽胞杆菌和乳杆菌(Bacilli和Lactobacilli,55属535种)第36页,共58页,2024年2月25日,星期天界Ⅱ:真细菌(Bacteria)部23:放线细菌(Actinobacteria,117属,1371种)部24:浮霉状菌和衣原体(Planctomycetes和Chlamydia,5属14种)部26:丝状杆菌(Fibrobacters,3属5种)部27:拟杆菌(Bacteroides,20属130种)第37页,共58页,2024年2月25日,星期天界Ⅱ:真细菌(Bacteria)部28:黄杆菌(Flavobacteria,15属72种)部29:鞘氨醇杆菌(Sphingobacteria,22属76训)部30:梭形菌(Fusoforms,6属29种)部31:疣微菌和相关细菌(Verrucomicrobium,2属5种)第38页,共58页,2024年2月25日,星期天二真菌(菌物)分类系统简介Ainsworthetal(1973)V.Arx(1981)真菌字典(1983)Kendrick(1992)真菌字典(1995)AlexopoulosMins(1996)第39页,共58页,2024年2月25日,星期天黏菌门:黏菌纲根肿菌纲
真菌门:鞭毛菌亚门:壶菌纲丝壶菌纲卵菌纲
接合菌亚门:接合菌纲毛菌纲
子囊菌亚门:半子囊菌纲不整囊菌纲核菌纲
盘菌纲腔菌纲虫囊菌纲
担子菌亚门:冬孢菌纲层菌纲腹菌纲
半知菌亚门:芽孢纲丝孢纲腔孢纲真菌界(1995)第40页,共58页,2024年2月25日,星期天第四节微生物分类鉴定的方法生物分类的传统指标分子生物学指标微型、简便、快速或自动化鉴定技术细菌的数值分类第41页,共58页,2024年2月25日,星期天
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