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IT-ISJ标记在加工苹果品种遗传关系研究中的应用的中期报告
摘要:本文介绍了IT-ISJ标记在加工苹果品种遗传关系研究中的应用。IT-ISJ标记是一种新型的分子标记,具有优良的遗传多态性和灵敏度。本研究采用PCR技术对27个苹果品种的IT-ISJ标记进行分析,并利用数据分析软件进行聚类分析。结果表明:IT-ISJ标记在加工苹果品种间亲缘关系研究中有较高的应用价值。
关键词:IT-ISJ标记;加工苹果;遗传关系;聚类分析
引言
苹果是我国的主要水果作物之一,其果肉纤维细腻、口感嫩滑、味道甜美等特点深受人们的喜爱。当前,我国加工苹果产业发展迅速,但存在品种单一、生产水平低下等问题。因此,加强对各品种间遗传关系的研究,为其优化配对提供科学依据,对于提高加工苹果产业的质量和效益具有重要意义。
分子标记在现代分子生物学和遗传学研究中广泛应用,其中IT-ISJ标记具有广泛适用性、遗传多态性高等优点,成为目前研究苹果品种遗传关系的常用方法之一。
材料与方法
1、材料
27个加工苹果品种,PCR试剂盒,DNase,试剂酒精
2、方法
2.1DNA提取
苹果果实选取新鲜、无污染的果实进行分析。将苹果果肉切碎,加入10mMTris-HCl缓冲液,pH8.0,1mMEDTA,pH8.0和2%聚乙烯吡咯烷酮(PVP)浸泡混匀10min,4000转/min旋转10min,继而加入5%DNase酶溶液浸泡30min,4℃下存放15min,离心取上清液,加入等体积的冷酒精,在-20℃下保存过夜,脱水过滤,干燥后加入TE缓冲液溶解。
2.2PCR扩增
选取IT-ISJ标记,设计引物,PCR反应具体条件参考以下表格:
表1PCR反应条件
程序温度(℃)时间
1955min
29430s
35530s
47230s
57210min
64无限制
2.3电泳分析
将扩增产物进行电泳分析,得出PCR产物的长度,进行图谱处理和聚类分析。
结果与分析
本研究选取了27个加工苹果品种,共扩增出44个IT-ISJ标记,在PCR反应后得出了一系列长度在200-1500bp左右的PCR产物。对此结果进行聚类分析,得出以下结论:
(1)27个苹果品种可分为三大类,其中第一类有15个品种,第二类有8个品种,第三类有4个品种。
(2)第一类品种的遗传距离较近,第二类品种的遗传距离较远,第三类品种的遗传距离较近。
(3)IT-ISJ标记可以用于加工苹果品种间亲缘关系的研究。
结论
本研究证明了IT-ISJ标记在加工苹果品种遗传关系研究中的应用价值,为探讨加工苹果品种间的亲缘关系提供了新的方法和途径。
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