基因组的结构与功能.ppt

**1989年提出以序列标志位点（sequence-taggedsite，STS）为制作物理图的通用语言，目标是使物理图STS标志之间的距离达到100kb左右，并对人类基因组大部分区域的各个克隆拼接超过2Mb。**人类基因组计划的最终目标是测定总长度约一米，由近30亿个核苷酸组成的人基因组DNA全序列。这项工作随着分子克隆技术和DNA自动测序技术的提高而不断超越原来的时间表。全部基因组序列测定已经在2001年提前完成，并将在2003年完成22条常染色体以及X和Y染色体的全部序列的排列分析，绘制出人类基因组精确图谱。**Genes：Annotationofthegenomesequencehasidentifiedover30,000genes,plusmanyotherfeaturessuchasrepeatsequencesandCpGislands.在人类基因组中，真正为蛋白质编码的序列仅占1%-5%。而在每一种细胞中，这些编码序列又仅有10%左右专一表达。如果抓住了mRNA（或cDNA）序列，就抓住了基因功能的主要部分。从不同组织中提取mRNA，合成cDNA，然后大规模测序这一策略很快作为人类基因组计划的一部分得到承认，并且迅速被一些大公司采用。cDNA片段被称为表达序列标签（ExpressedsequenceTag，EST），目前已经得到了近430万条人的EST（至2002年3月29日）。**回顾70年代以来癌症研究的进展，使人们认识到包括癌症在人类疾病的发生，都与基因直接、间接有关；同时指出，要么仍处在零打碎敲的方法研究，要么从整体上研究和分析整个人类基因组及其序列。为此，1985年首先由美国科学家提出HGP，1990年HGP正式启动。3.启动子

4.增强子5.加尾信号(responseelements)(enhancer)一些信息分子的受体被细胞外信息分子激活后，能与特异的DNA序列结合，调控基因的表达。这种特异的DNA序列由于能介导基因对细胞外的某种信号产生反应被称为反应元件，实际上也是顺式作用元件。是含有多个能被反式作用因子识别与结合的顺式作用元件。反式作用因子与这些元件结合后能够调控(通常为增强)邻近基因的转录。增强子内含负调控序列，称为负增强子(negativeenhancer)，又称沉默子(silencer)。在结构基因最后一个外显子中有一个保守的AATAAA序列，这个序列对于mRNA转录终止和加poly(A)尾是必不可少的。此位点下游有一段GT或T丰富区，此区与AATAAA序列共同构成poly(A)加尾信号。mRNA转录到此部位后，产生AAUAAA和随后的GU(或U)丰富区。与RNA聚合酶结合的延长因子可以识别这种结构并与之结合，然后在AAUAAA下游10~30个碱基的部位切断RNA，并加上poly(A)尾。第29页,共54页，2024年2月25日，星期天(三)基因家族基因家族––是指核苷酸序列或编码产物的结构具有一定程度同源性，具有类似功能的一组基因。*同一个家族的基因成员是由同一祖先基因进化而来，同源性最高的可达100％(即多拷贝基因)。同源性也可以很低，只有一小段序列相同。*在多基因家族中的基因，其编码产物常常具有相似的功能，而在基因超家族中，则有许多基因的编码产物在功能上毫无相同之处。(genefamily)––亦称多基因家族(multigenefamily)第30页,共54页，2024年2月25日，星期天基因家族的类型根据家族内各成员同源性的程度，基因家族主要有以下几种类型:1.核苷酸序列相同––实际上是多拷贝基因。如rRNA基因家族，tRNA基因家族，组蛋白基因家族等。2.核苷酸序列高度同源3.编码产物具有同源功能区某些具有家族成员之间，基因全长序列的相似性可能较低，但基因编码的产物具有高度保守的功能区。如src癌基因家族4.编码产物具有小段保守基序有些基因家族中各成员的DNA序列可能并不明显相关，而所编码的产物缺具有共同的功能特征，存在小段保守的氨基酸基序。5.基因超家族(supergenefamily)由多基因家族及单基因组成的更大的基因家族。成员间有不同程度的同源，但功能并不相似。最经典的基因超家族是免疫球蛋白基因超家族。6.假基因––在多基因家族中，某些成员并不能表达出有功能的产物，这些基因称为假基因，用?表示。第31页,共54页，2024年2月25日，星期天(四)重复序列1.高度重复序列(＞105次)2.中度重复序列(101~105次)中度重复序列散在分布于基因组中，