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PDK1基因敲除小鼠中与心衰相关的长链非编码RNA(LncRNA)的筛选的开题报告
一、研究背景和意义
心衰是一种严重的心脏疾病,其发生与多种因素有关,包括遗传因素、环境因素以及生活方式等。长链非编码RNA(LncRNA)是一类长度大于200nt的RNA分子,不编码蛋白质,可以通过调节基因表达,参与多种生物学过程,如细胞增殖、分化和信号传导等。前期研究表明,LncRNA与心血管疾病密切相关。然而,LncRNA在心衰发病机制中的具体作用仍然不清楚。
PDK1是一种蛋白激酶B(AKT)活化的关键酶,通过调节心肌细胞代谢和增殖来维护心脏功能。前期研究表明PDK1在心衰中发挥重要作用,但与其相互作用的LncRNA尚未完全阐明。
通过筛选心衰相关的LncRNA,可以深入了解其作用机制,从而为心衰的诊断和治疗提供新的思路和方法。
二、研究内容和方法
本研究将利用PDK1基因敲除小鼠心脏组织中的转录组学技术,筛选心衰相关的LncRNA,并对其表达进行定量PCR验证。
1.建立PDK1基因敲除小鼠模型
从基因敲除小鼠库中选取PDK1基因敲除小鼠进行繁殖,并利用PCR和Westernblotting等技术检测敲除效果。
2.转录组学分析
收集PDK1基因敲除小鼠和野生型小鼠的心脏组织,从中提取RNA,构建RNA-seq文库,利用高通量测序技术对文库进行测序,筛选与心衰相关的LncRNA。
3.表达验证
利用定量PCR技术验证筛选出的LncRNA的表达水平,并与野生型对照组进行比较分析。
三、预期结果和意义
本研究将通过筛选心衰相关的LncRNA,深入了解其作用机制,从而为心衰的诊断和治疗提供新的思路和方法。同时,本研究还将为进一步探究PDK1与心衰的关系提供基础数据。
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