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基于预训练表征和自注意力的siRNA抑制率预测方法.pdfVIP

基于预训练表征和自注意力的siRNA抑制率预测方法.pdf

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    一种基于预训练表征和自注意力的siRNA抑制率预测方法，在离线阶段通过构建基于自注意力机制的深度神经网络，并针对siRNA的反义链序列和局部靶mRNA序列构建多种特征，用于对深度神经网络进行训练，在在线阶段采用训练后的深度神经网络对实时输入的待检测siRNA序列进行抑制率的预测。本发明对于siRNA的反义链序列和局部靶mRNA序列，利用预训练RNA‑FM模型进行嵌入式表征，转化为二维特征矩阵，在加上位置编码后，通过自注意力机制提取序列全局性的依赖信息，再加上来自热力学属性的特征作为全连接层的输入

    (19)国家知识产权局

    (12)发明专利申请

    (10)申请公布号CN118098357A

    (43)申请公布日2024.05.28

    (21)申请号202410149193.0

    (22)申请日2024.02.02

    (71)申请人上海交通大学

    地址200240

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