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重组DNA技术
RecombinantDNATechnology;重组DNA技术(recombinantDNAtechnology)
又称分子克隆(molecularcloning)或DNA克隆(DNAcloning)或基因克隆(genecloning)技术,是指在体外利用酶学方法将目标DNA片段与能自主复制遗传元件(又叫载体)连接,形成重组DNA分子,进而在受体细胞中复制、扩增,从而取得单一DNA分子大量拷贝。
;第一节
重组DNA技术中惯用
工具酶
FrequentlyUsedEnzymesinRecombinantDNATechnology
;重组DNA技术中惯用工具酶;一、限制性核酸内切酶用于切割DNA;第一个字母取自产生该酶细菌属名,用大写斜体;
第二、第三个字母是该细菌种名,用小写斜体;
第四个字母(有时无)代表株(可大写或小写);
用罗马数字表示发觉先后次序。;(二)Ⅱ型限制性内切酶含有一些共性和特征;2.识别核苷酸序列通常为回文结构(palindrome);BamHⅠ;同尾酶(isocaudarner)
有些限制性内切酶即使识别序列不完全相同,但切割DNA后,产生相同黏端,这么酶彼此互称为同尾酶。这两个相同黏端称为配伍末端(compatibleend)。;GGATCC
CCTAGG;6.切割会受其它原因影响
限制性内切酶通常不能切割在识别位点内有特异碱基甲基化序列。
缓冲液或环境温度也会影响一些酶特异性。比如,EcoRI在正常情况下识别“-GAATTC-”序列,但在甘油浓度大于5%(v/v)或反应温度较低时识别序列可变为“-AATT-”或“-嘌呤嘌呤AT嘧啶嘧啶-”,这种现象称为星号活性(staractivity),以EcoRI*表示。;二、DNA连接酶用于催化DNA片段连接;
1.大肠杆菌染色体编码DNA连接酶
需NAD+作为辅因子
2.大肠杆菌T4噬菌体DNA编码T4DNA连接酶
需ATP作为辅因子
;三、重组DNA技术中还需使用其它惯用工具酶;来自于大肠杆菌(bacterialalkalinephosphatase,BAP)或小牛肠(calfintestinalalkalinephosphatase,CIP)。用于脱去DNA(RNA)5′末端磷酸基团,使5′-P成为5′-OH,该过程称核酸分子脱磷酸作用。;(二)反转录酶以RNA为模板合成cDNA;;大肠杆菌DNA聚合酶I(DNApolymeraseI)是基因工程中惯用DNA聚合酶。其除含有5′→3′聚合酶活性外,还有3′→5′及5′→3′核酸外切酶活性。因其含有5′→3′核酸外切酶活性而惯用于DNA探针缺口平移法(nicktranslation)标识。;DNA聚合酶I用枯草杆菌蛋白酶(subtilisin)裂解后产生大片段,也称为Klenow片段(Klenowfragment)。其保留了5′→3′聚合酶活性及3′→5′外切酶活性,失去了5′→3′外切酶活性。
Klenow片段主要用途有:①补齐双链DNA3′末端,使其转变成平端;或经过补齐3′端而使3′末端标识;②在cDNA克隆中,用于第二股链合成;③用于DNA序列分析。;(六)TaqDNA聚合酶惯用于PCR;(七)多核苷酸激酶可使寡核苷酸链5′羟基末端磷酸化;第二节
目标DNA获取
PreparationofInterestedDNA;一、化学合成法可直接合成目标DNA?;*化学合成法获取目标DNA;
第一步:构建基因组DNA文库(是指包含某一个生物细胞或组织全部基因组DNA序列随机克隆群体,以DNA片段形式贮存了全部基因组DNA信息)。
第二步:筛选含有目标基因克隆。;组织或细胞染色体DNA;三、从cDNA文库中获取目标DNA
第一步:构建cDNA文库(包含某一组织细胞在一定条件下所表示全部mRNA经反转录而合成cDNA序列克隆群体,它以cDNA片段形式贮存了全部基因表示信息)。
第二步:筛选含有目标cDNA克隆。
;;从基因组DNA文库或cDNA文库中筛选目标DNA策略
1.菌落或噬斑原位杂交
2.针对表示文库,可用抗原-抗体或配体-受体结合原理(亲和筛选法)筛选;假如已经知道目标基因序列,就能很方便地用PCR反应,从基因组DNA或cDNA中取得目标基因,可无须要经过复杂DNA文库构建过程。
PCR是一个高效
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