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无缝克隆同源重组克隆

Gibsonassembly

简介(INTRODUCTION)

原理:Gibsonassembly是一种onestep,onepot的迅速基因组装方法。它只要要将基因片段和需要

的三种酶混淆在同一个管内在50°C下培育15-60min就能够获得组装好的DNA。

装置原理鉴于DNA片段间的重叠地区,过程依靠于三种酶:DNA外切酶(T5exonuclease),高保

真DNA聚合酶。(Phusionpolymerase)和耐热DNA连结(TaqDNAligase)的共同作用。首

先,T5核酸外切酶消化DNA片段的链方向是从5’到3’.每个DNA片段分别形成一个单链的突出部分,

因为着这两个相邻的突出片段有一部分拥有同源性能够互补,因此DNA片段退火,互补的序列从头配对连

结。而后,在空缺的部分DNA聚合酶以另一条DNA单链为模板,沿3方向将对应的脱氧核苷酸连结到单

链上,填充缺口。最后,连结酶将两条DNA单链黏合起来,密封裂痕。这样拥有重叠地区的DNA片段就

组装成一整条DNA分子了。下边是组装的表示图。

资料(MATERIALS)

试剂(REAGENTS)

NAD,H2O,1MMgCl2,1MDTT,10mMdNTPmix,1MTris-HClpH,50%PEG-8000,mg/

mLTagligase,μg/mLT5_ExO,Phusion(1×)、LB培育基、抗生素(据载体而定)、LB平板(相

应抗性)

实验前准备(SETUP)

于冰水浴中配制以下反响系统。假如不慎将液体粘在管壁,可通太短暂离心使其沉入管底。

4xisothermalassemblybuffer

NAD20mg

H2O300μL

1MMgCl2300μL

1MDTT300μL

10mMdNTPmix600μL

1MTris-HClpH3mL

无缝克隆同源重组克隆

50%PEG-80003mL

加水到mL,每管分500μL存于-20°C或-80°C冰箱,够3000个反响

2×assemblymix:bestcombination:

100reaction1mL

mg/mLTagligase10μL

μg/mLT5_ExO100μL

Phusion(1×)25μL

4×.buffer500μL

加水365μL,存于-20°C冰箱,有效期1年。

实验步骤(PROCEDURE)

设计引物经过PCR的方法在DNA片段的两头加上同源片段,NEB介绍同源片段的长度为15-40

bp,同时要求这部分对应的退火温度高于4°C。

1.进行DNA纯化:PCR产物进行琼脂糖电泳,胶回收。或许PCR产物回收试剂盒回收。

2.进行重组反响,以20μL反响系统为例:

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