实验动物微卫星DNA、斑马鱼SNP遗传标记的检测方法、MHC单倍型实验鸡和实验鸭直接测序检测方法.docxVIP

（规范性）

实验动物微卫星DNA标记遗传检测方法

基因组DNA的提取

基因组DNA提取方法按照NY/T1673的规定执行。

微卫星位点

用于检测封闭群和近交系实验小型猪遗传质量的微卫星位点分别为25个和10个，各微卫星位点的名称、染色体位置、引物序列、等位基因数、等位基因范围和退火温度按照表A.1的规定执行。

实验小型猪微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围

位点

引物序列(5′～3′)

所在染色体

Mg2+浓度（mM）

退火温度(℃)

等位基因数

等位基因范围

适用群体

SW974

GGTGAAGTTTTTGCTTTGAACC

GAAAGAAATCCAAATCCAAACC

1

2.0

58

17

129～175

封闭群

S0091

TCTACTCCAGGAGATAAGCCAGAT

CAGTGACTCCATGCACAGTTATGA

2

1.5

55

14

96～174

封闭群

SW240

AGAAATTAGTGCCTCAAATTGG

AAACCATTAAGTCCCTAGCAAA

2

1.5

58

11

92～114

封闭群

SW1066

GCAGGATGAACCACCCTG

CTCTTGAGGCAACCTGCTG

3

2.0

60

19

166～214

封闭群

SW1089

TTTTCCCCTTCACTCACCC

GATCAAAGTCCCTTACTCCGG

4

1.5

58

10

142～190

封闭群

S0005

TCCTTCCCTCCTGGTAACTA

GCACTTCCTGATTCTGGGTA

5

2.0

54

11

204～244

封闭群

SW1057

TCCCCTGTTGTACAGATTGATG

TCCAATTCCAAGTTCCACTAGC

6

2.0

58

14

142～191

封闭群

SW632

TGGGTTGAAAGATTTCCCAA

GGAGTCAGTACTTTGGCA

7

2.0

54

9

148～173

封闭群

OPN

CCAATCCTATTCACGAAAAAGC

CAACCCACTTGCTCCCAC

8

2.0

59

12

138～170

封闭群

SW29

AGGGTGGCTAAAAAAGAAAAGG

ATCAAATCCTTACCTCTGCAGC

8

2.0

61

12

133～187

封闭群

SW911

CTCAGTTCTTTGGGACTGAACC

CATCTGTGGAAAAAAAAAGCC

9

2.0

60

14

151～178

封闭群

SW511

AAGCAGGAATCCCTGCATC

CCCAGCCACCAGTCTGAC

9

1.5

62

12

161～196

封闭群

SWr158

TCCAATTCAACTCCTGGCTC

GAATGTGCACATACCACATGC

10

2.0

60

18

158～200

封闭群

SW951

TTTCACAACTCTGGCACCAG

GATCGTGCCCAAATGGAC

10

1.5

58

14

108～142

封闭群

SW271

TTCCAGTGGCTTTCTGTGC

CATTCATTCCCAGTGAAACTTG

11

1.5

58

13

111～144

封闭群

S0386

TCCTGGGTCTTATTTTCTA

TTTTTATCTCCAACAGTAT

11

2.0

48

12

155～178

封闭群

S0068

CCTTCAACCTTTGAGCAAGAAC

AGTGGTCTCTCTCCCTCTTGCT

13

2.0

62

10

210～256

封闭群

SWr1008

ACAGCCACCAACAGTGTTTG

GAACTTCCATATGCTGCAAGTG

13

2.0

62

16

98～256

封闭群

S0007

TTACTTCTTGGATCATGTC

GTCCCTCCTCATAATTTCTG

14

2.0

54

15

142～192

封闭群

SW857

TGAGAGGTCAGTTACAGAAGACC

GATCCTCCTCCAAATCCCAT

14

2.0

58

16

129～173

封闭群

SWr312

ATCCGTGCGTGTGTGCAT

CTGGTGGCTACAGTTCCGAT

15

1.5

64

11

116～136

封闭群

SW81

gatctggtcctgcacaggg

GGGGCTCTCAGGAAGGAG

16

1.5

60

8

128～144

封闭群

SWr1120

CAAATGGAACCCATTACAGTCC

ACTCCTAGCCCAGGAGCTTC

17

1.5

60

11

147～178

封闭群

S0062

AAGATCATTTAGTCAAGGTCACAG

TCTGATAGGGAACATAGGATAAAT

1