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26.3IonicbondingNa(1s22s22p63s)5.14eVNa+Cl(1s22s22p63s23p5)+e?Cl–+3.61eVelectronaffinityFreeNaClasE=0S=0d
Twoionscomecloserandreleaseenergyfurther.Thecloser,themorestable?Collapse?Na+(1s22s22p6)Cl–(1s22s22p63s23p6)Ifcollapse,p-orbitalswilloverlap!Quantumeffectdominates.theequilibriumseparationis0.236nmenergyis–4.26eV.Theanswerisno!Cancompletedp-orbitalsoverlapeachother?Canotherelectronsenteracompletedshell?
Ionicorcovalent?Generallyhomonucleardiatomicmoleculesareformedthroughcovalentbonds.Afiniteelectricdipoleisindicationofionicbond.thereisno“pure”covalentbond.Whileinheteronuclearmolecules
InNaCltheseparationis0.236nmButthemeasuredelectricdipolemomentis3.00×10–29C·mpercentionicityis3.00/3.78=79.4%离子性,电离度
Intermolecularforce:chemicalbonds(200~500kJ·mol–1)hydrogenbonds(5~50kJ·mol–1)induceddipoleforce(~r–7)dipole-dipoleinteraction(~r–3)
polypeptidechainsH2OAminoacidresidue
26.4MoleculevibrationandrotationThevibrationenergylevelsTherotationenergylevels
BoltzmannfactornormalizationStatisticalDistributionofSHO
*26.5BiologicalmacromoleculeproteinsandnucleicacidsProteinsinnaturearebuiltoftwentykindsofaminoacidssidechain羧基氨基RH
aminoacids(氨基酸)1.Tryptophan(Trp)色氨酸2.Isoleucine(Ile)异亮氨酸3.Tyrosine(Tyr)酪氨酸4.Phenylalanine(Phe)苯丙氨酸5.Proline(Pro)脯氨酸6.Leucine(Leu)亮氨酸7.Valine(Val)缬氨酸8.Lysine(Lys)赖氨酸9.Histidine(His)组氨酸10.Methionine(Met)甲硫氨酸11.Alanine(Ala)丙氨酸12.Arginine(Arg)精氨酸13.Cysteine(Cys)半胱氨酸14.Glutamicacid(Glu)谷氨酸15.Asparticacid(Asp)天门冬氨酸16.Threonine(Thr)苏氨酸17.Serine(Ser)丝氨酸18.Glycine(Gly)甘氨酸19.Aspara
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