萘醌及其衍生物药化生nmr wps2.pptx

萘醌及其衍生物

与

G四联体相互作用的确证演讲人：梁晨雪BYNMR

一些要点题目：Molecularrecognitioninnaphthoquinonederivatives—G-quadruplexcomplexesbyNMRaDepartmentofBiotechnologyandBiosciences,UniversityofMilano-Bicocca,Piazzadellascienza3,20126Milan,ItalybDepartmentofChemicalandBiologicalEngineering,ChalmersUniversityofTechnologySE-41296G?teborg,SwedencDepartmentofFood,EnvironmentalandNutritionalSciences,DivisionofChemistryandMolecularBiology,UniversityofMilan,ViaCeloria2,20133Milan,ItalydScientiaAdvice,Desio,Italy作者：BenedettaRivaa,RubenFerreirab,1,LoanaMussoc,RobertoArtalid,LeonardoScaglionic,StefaniaMazzinic,*发表时间：2015年4月

查找方法：一些要点期刊名称：中科院分区：JCR影响因子IF：SCIEtargetrecognitionBiochimicaetBiophysicaActa，BBA3.829（2013）卷:?1850期:?4页:?673-680

实验目的利用NMR确证靶标与靶点结合。靶标：端粒原癌基因启动子配体：萘酚及其衍生物结合后，通过促进肿瘤细胞端粒结构的结构改变（形成四联体），使得端粒酶无法识别并结合端粒，抑制了癌细胞端粒的延长，从而消除了肿瘤细胞“不死性”，达到抑制甚至杀死肿瘤细胞的目的。

实验原理G四联体（DNA的特殊构像）可能在端粒末端、线粒体DNA、RNA、或基因启动子G富集区中出现，，从而调控细胞生命活动原癌基因：c-myc它的异常过量表达与许多人体的肿瘤细胞合成有关关于靶标端粒返回

发现具有治疗活性分子团：萘酚及其衍生物实验原理关于药物但并不是作用于原先设计的靶标Hsp90（也是具有抑癌作用）通过分析他们中一部分的结构，发现他们可以具有与G蛋白结合的可能正题：研究它们是否可以结合（G四联体是否是其潜在靶点）返回

核磁原理处于外磁场的物质的原子核受到相应频率的电磁波作用时，在其磁级之间发生的共振跃迁现象。π-π堆积作用的检测π-π堆积使得H核周围电荷密度大，需要更多的能量才能满足出峰要求（剧烈震动，跃迁），所以它的峰向高场（右）移我们可以根据不同加药浓度下，G-四联体不同核苷酸碱基的-NH-上H核峰的迁移，来判断药物与靶标是否发生作用。通过NMR可以确定药物与靶标作用的化学计量数，以及药物与靶标的作用位点。实验原理NMR返回

二维NOE图谱简称为NOESY（NuclearOverhauserEffectSpectroscopy）,它反映了有机化合物中核与核之间空间距离的关系，而与两者之间相距多少根化学键无关主要用于检测核的Overhauser效应（nuclearoverhausereffect，NOE）：当分子间有空间位置相近的的两个质子Ha和Hb，若干扰场B2照射Hb，被干扰的Hb谱线饱和（即持续处于高能级，而不放出信号），这时Ha如果Ha与Hb频率相近，则二者将发生能量转换，从而使得Ha的能量升高，Ha共振信号就会增加。这种现象称为NOE。这里的二维图谱是指药物（配体）的H谱和G-四联体的H谱两个维度，产生NOE的H核出峰，将所出的峰相交即可得耦合情况实验原理NOESY二维图谱

样品准备：准备双链DNA片段（控制组）、G-四联体片段[进行选择性的分析]准备药品（配体）实验准备利用荧光初步筛选出哪些药物与G四联体的稳定有较密切关系得1a和1b效果最佳利用1a和1b进行NMR试验这一基因包含了人类端粒的全部基本单位这个基因与c-myc（原癌基因的一种）相似性很高实验结果用计算机软件模拟可视化

利用核磁-测量1a与靶标相互作用的化学计量数，确定结合位点数实验步骤NMR利用荧光-测试所选的化合物是否对于G-四联体有特异性选择结合后DNA的Tm发现增加了超过15℃利用二维NOESY谱（