- 1、本文档共25页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 5、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 6、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 7、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 8、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
1:核酸抽提原理
简单地讲,核酸抽提包含样品的裂解和纯化两大步骤。裂解是使样品中的核酸游离在裂解
体系中的过程,纯化则是使核酸与裂解体系中的其它成分,如蛋白质、盐及其它杂质彻底
分离的过程。
经典的裂解液几乎都含有去污剂(如SDS、TritonX-100、NP-40、Tween20等)和
盐(如Tris、EDTA、NaCl等)。盐的作用,除了提供一个合适的裂解环境(如Tris),还
包括抑制样品中的核酸酶在裂解过程中对核酸的破坏(如EDTA)、维持核酸结构的稳定
(如NaCl)等。去污剂则是通过使蛋白质变性,破坏膜结构及解开与核酸相连接的蛋白
质,从而实现核酸游离在裂解体系中。裂解体系中还可能加入蛋白酶;利用蛋白酶将蛋白
质消化成小的片段,促进核酸与蛋白质的分开,同时,也便于后面的纯化操作以及获得更
纯的核酸。也有直接使用高浓度的蛋白质变性剂(如GIT、GuHCl等)裂解的,该方法已
经成为了RNA抽提的主流,却不是基因组DNA抽提的主流。
最常用的纯化方法,一是PC抽提+醇沉淀,二是介质纯化。第一种方法是利用PC对裂
解体系进行反复抽提以去除蛋白质,实现核酸与蛋白质的分离;再用醇将核酸沉淀下来,
实现核酸与盐的分离。第二种方法则是利用某些固项介质,在某些特定的条件下,选择性
地吸附核酸,而不吸附蛋白质及盐的特点,实现核酸与蛋白质及盐的分离。高盐沉淀去除
蛋白质是第一种纯化方法的一个变体,省略了PC操作的麻烦。当然,也有不纯化的抽提
方法,但是用途多局限于简单的PCR。其它杂质–如多糖、多酚等-的去除,基本上都
是在这两种方法的基础上,通过增加一些特别的试剂,或者增加一些额外的步骤来实现
的。
2:了解你的实验样品
如果你研究某个实验样品,并且要抽提它的核酸,以下的信息一定要先行收集:该样品的
核酸含量、酶含量、特殊杂质含量。如果你对样品的特点一无所知,当样品稍微有一点复
杂时,抽提核酸的实验就会碰到许多问题。以血液为例,如果你不知道鸟的血液中有核细
胞的含量是人血的千倍左右,而使用人血一样的起始量去抽提鸟血的基因组DNA,怎么
可能成功?失败了又怎么知道原因所在?同时,只有对实验样品有所了解,才能正确选择
裂解方法。
绝大部分情况下,使用新鲜样品可以获得最好的结果。对一些杂质含量高的样品,如果使
用新鲜样品抽提基因组DNA是碰到杂质残留过大的问题,可以试一下-20C保存一天后
再抽提的对策,可能会有意想不到的效果。样品如果因为某些原因必须先行保存,也要先
简化一下样品:血液最好只保存有核细胞;将样品分割后保存,避免反复冻融。如果实验
室不具备合适的保存条件,将样品先裂解后再保存,是一个不错的选择。
3:裂解方法的评价
含蛋白酶的裂解方法,可以认为是抽提基因组DNA的首选。裂解包括膜蛋白的游离和与
基因组DNA相连接的蛋白质的游离。蛋白酶的作用是使蛋白质变小,故而对蛋白质的游
离有巨大的促进作用;同时,巨大的基因组DNA是很容易“缠”住大分子的东西的,蛋白
质被蛋白酶消化变小后,则不容易被基因组DNA“缠”住,有利于蛋白质在纯化操作中的
去除,使最终获得的基因组DNA的纯度更高。另外一个思路是,如果基因组DNA与蛋
白质“缠”在一起,在纯化的过程中有两种可能:如果基因组DNA的特性占优势,则纯化
时以DNA的形式被保留下来,导致蛋白质的残留;如果蛋白质的特性占优势,则纯化时
以蛋白质的形式被去除,导致DNA的损失。有些样品,如肌肉,即使是RNA抽提,也
强烈建议使用含蛋白酶的裂解液(或者在操作中的某个时候使用蛋白酶消化蛋白质),原
因在于这些样品中的蛋白质,是非常难以去除的。该方法是获得最大得率和最高纯度的基
础。
不使用蛋白酶的去污剂裂解方法,仍然在细胞基因组DNA
文档评论(0)